Protein–RNA interactions for Protein: Q15406

NR6A1, Nuclear receptor subfamily 6 group A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR6A1Q15406 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NR6A1Q15406 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NR6A1Q15406 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NR6A1Q15406 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NR6A1Q15406 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NR6A1Q15406 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NR6A1Q15406 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NR6A1Q15406 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NR6A1Q15406 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NR6A1Q15406 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NR6A1Q15406 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NR6A1Q15406 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NR6A1Q15406 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NR6A1Q15406 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NR6A1Q15406 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NR6A1Q15406 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NR6A1Q15406 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NR6A1Q15406 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NR6A1Q15406 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NR6A1Q15406 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NR6A1Q15406 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NR6A1Q15406 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NR6A1Q15406 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NR6A1Q15406 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NR6A1Q15406 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NR6A1Q15406 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NR6A1Q15406 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NR6A1Q15406 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NR6A1Q15406 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NR6A1Q15406 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NR6A1Q15406 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NR6A1Q15406 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NR6A1Q15406 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NR6A1Q15406 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NR6A1Q15406 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NR6A1Q15406 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NR6A1Q15406 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NR6A1Q15406 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NR6A1Q15406 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NR6A1Q15406 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NR6A1Q15406 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NR6A1Q15406 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NR6A1Q15406 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NR6A1Q15406 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NR6A1Q15406 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NR6A1Q15406 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NR6A1Q15406 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NR6A1Q15406 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NR6A1Q15406 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NR6A1Q15406 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NR6A1Q15406 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NR6A1Q15406 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NR6A1Q15406 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NR6A1Q15406 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NR6A1Q15406 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NR6A1Q15406 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NR6A1Q15406 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NR6A1Q15406 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NR6A1Q15406 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NR6A1Q15406 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NR6A1Q15406 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NR6A1Q15406 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NR6A1Q15406 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NR6A1Q15406 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NR6A1Q15406 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NR6A1Q15406 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NR6A1Q15406 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NR6A1Q15406 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NR6A1Q15406 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NR6A1Q15406 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NR6A1Q15406 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NR6A1Q15406 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NR6A1Q15406 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NR6A1Q15406 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NR6A1Q15406 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NR6A1Q15406 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NR6A1Q15406 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NR6A1Q15406 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NR6A1Q15406 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NR6A1Q15406 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NR6A1Q15406 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NR6A1Q15406 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NR6A1Q15406 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NR6A1Q15406 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NR6A1Q15406 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NR6A1Q15406 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NR6A1Q15406 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NR6A1Q15406 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NR6A1Q15406 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NR6A1Q15406 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NR6A1Q15406 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NR6A1Q15406 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NR6A1Q15406 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NR6A1Q15406 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NR6A1Q15406 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NR6A1Q15406 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NR6A1Q15406 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NR6A1Q15406 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NR6A1Q15406 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NR6A1Q15406 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms