Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TLR1Q15399 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TLR1Q15399 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TLR1Q15399 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TLR1Q15399 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TLR1Q15399 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TLR1Q15399 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TLR1Q15399 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TLR1Q15399 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TLR1Q15399 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TLR1Q15399 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TLR1Q15399 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TLR1Q15399 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TLR1Q15399 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TLR1Q15399 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TLR1Q15399 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TLR1Q15399 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TLR1Q15399 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TLR1Q15399 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TLR1Q15399 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TLR1Q15399 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TLR1Q15399 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TLR1Q15399 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TLR1Q15399 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TLR1Q15399 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TLR1Q15399 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TLR1Q15399 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TLR1Q15399 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TLR1Q15399 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TLR1Q15399 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TLR1Q15399 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TLR1Q15399 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TLR1Q15399 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TLR1Q15399 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TLR1Q15399 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TLR1Q15399 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TLR1Q15399 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TLR1Q15399 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TLR1Q15399 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TLR1Q15399 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TLR1Q15399 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TLR1Q15399 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TLR1Q15399 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TLR1Q15399 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TLR1Q15399 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TLR1Q15399 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TLR1Q15399 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TLR1Q15399 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TLR1Q15399 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TLR1Q15399 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TLR1Q15399 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TLR1Q15399 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TLR1Q15399 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TLR1Q15399 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TLR1Q15399 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TLR1Q15399 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TLR1Q15399 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TLR1Q15399 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TLR1Q15399 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TLR1Q15399 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TLR1Q15399 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TLR1Q15399 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TLR1Q15399 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TLR1Q15399 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TLR1Q15399 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TLR1Q15399 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TLR1Q15399 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TLR1Q15399 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TLR1Q15399 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TLR1Q15399 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TLR1Q15399 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TLR1Q15399 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TLR1Q15399 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TLR1Q15399 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TLR1Q15399 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TLR1Q15399 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TLR1Q15399 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TLR1Q15399 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TLR1Q15399 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TLR1Q15399 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TLR1Q15399 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TLR1Q15399 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TLR1Q15399 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TLR1Q15399 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TLR1Q15399 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TLR1Q15399 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TLR1Q15399 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TLR1Q15399 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TLR1Q15399 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TLR1Q15399 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TLR1Q15399 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TLR1Q15399 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TLR1Q15399 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TLR1Q15399 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TLR1Q15399 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TLR1Q15399 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TLR1Q15399 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TLR1Q15399 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TLR1Q15399 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TLR1Q15399 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
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