Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDK3Q15120 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDK3Q15120 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDK3Q15120 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDK3Q15120 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDK3Q15120 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDK3Q15120 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDK3Q15120 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDK3Q15120 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDK3Q15120 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDK3Q15120 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDK3Q15120 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDK3Q15120 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDK3Q15120 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDK3Q15120 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDK3Q15120 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDK3Q15120 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDK3Q15120 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDK3Q15120 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDK3Q15120 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDK3Q15120 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDK3Q15120 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDK3Q15120 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDK3Q15120 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDK3Q15120 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDK3Q15120 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDK3Q15120 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDK3Q15120 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDK3Q15120 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDK3Q15120 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDK3Q15120 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDK3Q15120 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDK3Q15120 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDK3Q15120 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDK3Q15120 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDK3Q15120 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDK3Q15120 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDK3Q15120 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDK3Q15120 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PDK3Q15120 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDK3Q15120 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDK3Q15120 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDK3Q15120 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDK3Q15120 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDK3Q15120 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDK3Q15120 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDK3Q15120 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDK3Q15120 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDK3Q15120 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDK3Q15120 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PDK3Q15120 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDK3Q15120 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDK3Q15120 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDK3Q15120 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDK3Q15120 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDK3Q15120 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDK3Q15120 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDK3Q15120 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDK3Q15120 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDK3Q15120 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDK3Q15120 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDK3Q15120 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDK3Q15120 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDK3Q15120 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDK3Q15120 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDK3Q15120 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDK3Q15120 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDK3Q15120 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDK3Q15120 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDK3Q15120 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDK3Q15120 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDK3Q15120 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDK3Q15120 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDK3Q15120 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDK3Q15120 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDK3Q15120 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDK3Q15120 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDK3Q15120 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDK3Q15120 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDK3Q15120 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDK3Q15120 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDK3Q15120 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDK3Q15120 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDK3Q15120 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDK3Q15120 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDK3Q15120 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDK3Q15120 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDK3Q15120 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDK3Q15120 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDK3Q15120 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDK3Q15120 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PDK3Q15120 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDK3Q15120 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDK3Q15120 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDK3Q15120 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDK3Q15120 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDK3Q15120 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDK3Q15120 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDK3Q15120 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDK3Q15120 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
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