Protein–RNA interactions for Protein: Q15047

SETDB1, Histone-lysine N-methyltransferase SETDB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETDB1Q15047 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SETDB1Q15047 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SETDB1Q15047 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SETDB1Q15047 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SETDB1Q15047 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SETDB1Q15047 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SETDB1Q15047 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SETDB1Q15047 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SETDB1Q15047 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SETDB1Q15047 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SETDB1Q15047 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SETDB1Q15047 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SETDB1Q15047 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SETDB1Q15047 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SETDB1Q15047 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SETDB1Q15047 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SETDB1Q15047 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SETDB1Q15047 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SETDB1Q15047 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SETDB1Q15047 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SETDB1Q15047 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SETDB1Q15047 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SETDB1Q15047 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SETDB1Q15047 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SETDB1Q15047 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SETDB1Q15047 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SETDB1Q15047 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SETDB1Q15047 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SETDB1Q15047 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SETDB1Q15047 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SETDB1Q15047 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SETDB1Q15047 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SETDB1Q15047 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SETDB1Q15047 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SETDB1Q15047 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SETDB1Q15047 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SETDB1Q15047 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SETDB1Q15047 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SETDB1Q15047 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SETDB1Q15047 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SETDB1Q15047 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SETDB1Q15047 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SETDB1Q15047 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SETDB1Q15047 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SETDB1Q15047 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SETDB1Q15047 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SETDB1Q15047 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SETDB1Q15047 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SETDB1Q15047 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SETDB1Q15047 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SETDB1Q15047 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SETDB1Q15047 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SETDB1Q15047 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SETDB1Q15047 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SETDB1Q15047 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
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SETDB1Q15047 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SETDB1Q15047 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
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SETDB1Q15047 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SETDB1Q15047 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
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SETDB1Q15047 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
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SETDB1Q15047 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SETDB1Q15047 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SETDB1Q15047 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SETDB1Q15047 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SETDB1Q15047 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SETDB1Q15047 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SETDB1Q15047 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SETDB1Q15047 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SETDB1Q15047 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SETDB1Q15047 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SETDB1Q15047 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SETDB1Q15047 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SETDB1Q15047 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SETDB1Q15047 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SETDB1Q15047 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SETDB1Q15047 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SETDB1Q15047 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SETDB1Q15047 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SETDB1Q15047 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SETDB1Q15047 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SETDB1Q15047 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SETDB1Q15047 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SETDB1Q15047 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SETDB1Q15047 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
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