Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RAB3GAP1Q15042 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RAB3GAP1Q15042 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
RAB3GAP1Q15042 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RAB3GAP1Q15042 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
RAB3GAP1Q15042 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
RAB3GAP1Q15042 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RAB3GAP1Q15042 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RAB3GAP1Q15042 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
RAB3GAP1Q15042 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RAB3GAP1Q15042 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RAB3GAP1Q15042 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RAB3GAP1Q15042 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RAB3GAP1Q15042 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RAB3GAP1Q15042 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RAB3GAP1Q15042 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RAB3GAP1Q15042 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RAB3GAP1Q15042 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RAB3GAP1Q15042 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RAB3GAP1Q15042 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
RAB3GAP1Q15042 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RAB3GAP1Q15042 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RAB3GAP1Q15042 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RAB3GAP1Q15042 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RAB3GAP1Q15042 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RAB3GAP1Q15042 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RAB3GAP1Q15042 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RAB3GAP1Q15042 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RAB3GAP1Q15042 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RAB3GAP1Q15042 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RAB3GAP1Q15042 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RAB3GAP1Q15042 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RAB3GAP1Q15042 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RAB3GAP1Q15042 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RAB3GAP1Q15042 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RAB3GAP1Q15042 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RAB3GAP1Q15042 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RAB3GAP1Q15042 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RAB3GAP1Q15042 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RAB3GAP1Q15042 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RAB3GAP1Q15042 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RAB3GAP1Q15042 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
RAB3GAP1Q15042 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RAB3GAP1Q15042 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RAB3GAP1Q15042 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RAB3GAP1Q15042 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RAB3GAP1Q15042 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
RAB3GAP1Q15042 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RAB3GAP1Q15042 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RAB3GAP1Q15042 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RAB3GAP1Q15042 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RAB3GAP1Q15042 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RAB3GAP1Q15042 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RAB3GAP1Q15042 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RAB3GAP1Q15042 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RAB3GAP1Q15042 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RAB3GAP1Q15042 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RAB3GAP1Q15042 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RAB3GAP1Q15042 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RAB3GAP1Q15042 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RAB3GAP1Q15042 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RAB3GAP1Q15042 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RAB3GAP1Q15042 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RAB3GAP1Q15042 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RAB3GAP1Q15042 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RAB3GAP1Q15042 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RAB3GAP1Q15042 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RAB3GAP1Q15042 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RAB3GAP1Q15042 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RAB3GAP1Q15042 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RAB3GAP1Q15042 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RAB3GAP1Q15042 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RAB3GAP1Q15042 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RAB3GAP1Q15042 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RAB3GAP1Q15042 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RAB3GAP1Q15042 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RAB3GAP1Q15042 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RAB3GAP1Q15042 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RAB3GAP1Q15042 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RAB3GAP1Q15042 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RAB3GAP1Q15042 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RAB3GAP1Q15042 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
RAB3GAP1Q15042 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
RAB3GAP1Q15042 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RAB3GAP1Q15042 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RAB3GAP1Q15042 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RAB3GAP1Q15042 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RAB3GAP1Q15042 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RAB3GAP1Q15042 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RAB3GAP1Q15042 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RAB3GAP1Q15042 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RAB3GAP1Q15042 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RAB3GAP1Q15042 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RAB3GAP1Q15042 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RAB3GAP1Q15042 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
RAB3GAP1Q15042 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RAB3GAP1Q15042 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
RAB3GAP1Q15042 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RAB3GAP1Q15042 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RAB3GAP1Q15042 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
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