Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ODF1Q14990 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ODF1Q14990 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ODF1Q14990 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ODF1Q14990 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ODF1Q14990 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ODF1Q14990 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ODF1Q14990 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ODF1Q14990 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ODF1Q14990 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ODF1Q14990 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ODF1Q14990 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ODF1Q14990 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ODF1Q14990 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ODF1Q14990 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ODF1Q14990 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ODF1Q14990 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ODF1Q14990 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ODF1Q14990 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ODF1Q14990 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ODF1Q14990 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ODF1Q14990 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ODF1Q14990 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ODF1Q14990 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ODF1Q14990 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ODF1Q14990 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ODF1Q14990 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ODF1Q14990 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ODF1Q14990 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ODF1Q14990 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ODF1Q14990 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ODF1Q14990 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ODF1Q14990 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ODF1Q14990 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ODF1Q14990 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ODF1Q14990 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ODF1Q14990 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ODF1Q14990 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ODF1Q14990 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ODF1Q14990 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ODF1Q14990 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ODF1Q14990 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ODF1Q14990 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ODF1Q14990 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ODF1Q14990 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ODF1Q14990 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ODF1Q14990 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ODF1Q14990 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ODF1Q14990 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ODF1Q14990 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ODF1Q14990 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ODF1Q14990 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ODF1Q14990 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ODF1Q14990 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ODF1Q14990 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ODF1Q14990 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ODF1Q14990 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ODF1Q14990 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ODF1Q14990 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ODF1Q14990 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ODF1Q14990 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ODF1Q14990 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ODF1Q14990 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ODF1Q14990 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ODF1Q14990 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ODF1Q14990 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ODF1Q14990 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ODF1Q14990 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ODF1Q14990 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ODF1Q14990 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ODF1Q14990 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ODF1Q14990 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ODF1Q14990 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ODF1Q14990 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ODF1Q14990 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ODF1Q14990 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ODF1Q14990 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ODF1Q14990 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ODF1Q14990 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ODF1Q14990 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ODF1Q14990 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ODF1Q14990 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ODF1Q14990 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ODF1Q14990 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ODF1Q14990 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ODF1Q14990 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ODF1Q14990 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ODF1Q14990 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ODF1Q14990 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ODF1Q14990 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ODF1Q14990 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ODF1Q14990 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ODF1Q14990 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ODF1Q14990 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ODF1Q14990 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ODF1Q14990 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ODF1Q14990 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ODF1Q14990 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ODF1Q14990 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ODF1Q14990 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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