Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GPNMBQ14956 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GPNMBQ14956 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GPNMBQ14956 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GPNMBQ14956 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
GPNMBQ14956 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GPNMBQ14956 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GPNMBQ14956 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GPNMBQ14956 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GPNMBQ14956 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GPNMBQ14956 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GPNMBQ14956 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GPNMBQ14956 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GPNMBQ14956 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GPNMBQ14956 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GPNMBQ14956 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GPNMBQ14956 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GPNMBQ14956 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GPNMBQ14956 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GPNMBQ14956 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GPNMBQ14956 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GPNMBQ14956 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GPNMBQ14956 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GPNMBQ14956 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GPNMBQ14956 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GPNMBQ14956 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GPNMBQ14956 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GPNMBQ14956 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GPNMBQ14956 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GPNMBQ14956 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GPNMBQ14956 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GPNMBQ14956 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GPNMBQ14956 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GPNMBQ14956 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GPNMBQ14956 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GPNMBQ14956 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GPNMBQ14956 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GPNMBQ14956 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GPNMBQ14956 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GPNMBQ14956 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GPNMBQ14956 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GPNMBQ14956 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GPNMBQ14956 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
GPNMBQ14956 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GPNMBQ14956 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GPNMBQ14956 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GPNMBQ14956 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GPNMBQ14956 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GPNMBQ14956 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GPNMBQ14956 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GPNMBQ14956 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GPNMBQ14956 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GPNMBQ14956 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GPNMBQ14956 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
GPNMBQ14956 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GPNMBQ14956 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GPNMBQ14956 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GPNMBQ14956 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GPNMBQ14956 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GPNMBQ14956 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GPNMBQ14956 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GPNMBQ14956 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GPNMBQ14956 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GPNMBQ14956 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GPNMBQ14956 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GPNMBQ14956 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GPNMBQ14956 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GPNMBQ14956 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GPNMBQ14956 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GPNMBQ14956 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GPNMBQ14956 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GPNMBQ14956 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GPNMBQ14956 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GPNMBQ14956 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GPNMBQ14956 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GPNMBQ14956 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GPNMBQ14956 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GPNMBQ14956 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GPNMBQ14956 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GPNMBQ14956 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GPNMBQ14956 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GPNMBQ14956 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
GPNMBQ14956 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GPNMBQ14956 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GPNMBQ14956 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GPNMBQ14956 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GPNMBQ14956 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
GPNMBQ14956 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GPNMBQ14956 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GPNMBQ14956 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GPNMBQ14956 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GPNMBQ14956 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GPNMBQ14956 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
GPNMBQ14956 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GPNMBQ14956 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GPNMBQ14956 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GPNMBQ14956 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GPNMBQ14956 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
GPNMBQ14956 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GPNMBQ14956 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms