Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GPNMBQ14956 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GPNMBQ14956 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GPNMBQ14956 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GPNMBQ14956 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
GPNMBQ14956 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GPNMBQ14956 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GPNMBQ14956 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GPNMBQ14956 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GPNMBQ14956 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GPNMBQ14956 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GPNMBQ14956 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GPNMBQ14956 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GPNMBQ14956 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GPNMBQ14956 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GPNMBQ14956 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GPNMBQ14956 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GPNMBQ14956 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GPNMBQ14956 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GPNMBQ14956 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GPNMBQ14956 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GPNMBQ14956 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GPNMBQ14956 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GPNMBQ14956 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GPNMBQ14956 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GPNMBQ14956 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GPNMBQ14956 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GPNMBQ14956 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GPNMBQ14956 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GPNMBQ14956 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GPNMBQ14956 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GPNMBQ14956 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GPNMBQ14956 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GPNMBQ14956 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GPNMBQ14956 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GPNMBQ14956 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GPNMBQ14956 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GPNMBQ14956 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GPNMBQ14956 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GPNMBQ14956 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GPNMBQ14956 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GPNMBQ14956 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GPNMBQ14956 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
GPNMBQ14956 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GPNMBQ14956 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GPNMBQ14956 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GPNMBQ14956 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GPNMBQ14956 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GPNMBQ14956 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GPNMBQ14956 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GPNMBQ14956 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GPNMBQ14956 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GPNMBQ14956 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GPNMBQ14956 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
GPNMBQ14956 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GPNMBQ14956 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GPNMBQ14956 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GPNMBQ14956 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GPNMBQ14956 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GPNMBQ14956 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GPNMBQ14956 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GPNMBQ14956 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GPNMBQ14956 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GPNMBQ14956 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GPNMBQ14956 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GPNMBQ14956 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GPNMBQ14956 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GPNMBQ14956 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GPNMBQ14956 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GPNMBQ14956 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GPNMBQ14956 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GPNMBQ14956 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GPNMBQ14956 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GPNMBQ14956 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GPNMBQ14956 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GPNMBQ14956 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GPNMBQ14956 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GPNMBQ14956 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GPNMBQ14956 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GPNMBQ14956 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GPNMBQ14956 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GPNMBQ14956 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
GPNMBQ14956 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GPNMBQ14956 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GPNMBQ14956 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GPNMBQ14956 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GPNMBQ14956 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
GPNMBQ14956 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GPNMBQ14956 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GPNMBQ14956 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GPNMBQ14956 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GPNMBQ14956 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GPNMBQ14956 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
GPNMBQ14956 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GPNMBQ14956 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GPNMBQ14956 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GPNMBQ14956 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GPNMBQ14956 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
GPNMBQ14956 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GPNMBQ14956 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
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