Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CACNA1SQ13698 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CACNA1SQ13698 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CACNA1SQ13698 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CACNA1SQ13698 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CACNA1SQ13698 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CACNA1SQ13698 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CACNA1SQ13698 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CACNA1SQ13698 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CACNA1SQ13698 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CACNA1SQ13698 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
CACNA1SQ13698 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CACNA1SQ13698 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CACNA1SQ13698 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CACNA1SQ13698 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CACNA1SQ13698 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CACNA1SQ13698 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CACNA1SQ13698 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
CACNA1SQ13698 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CACNA1SQ13698 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CACNA1SQ13698 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CACNA1SQ13698 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CACNA1SQ13698 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CACNA1SQ13698 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CACNA1SQ13698 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CACNA1SQ13698 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
CACNA1SQ13698 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CACNA1SQ13698 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CACNA1SQ13698 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CACNA1SQ13698 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CACNA1SQ13698 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CACNA1SQ13698 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CACNA1SQ13698 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CACNA1SQ13698 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CACNA1SQ13698 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CACNA1SQ13698 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
CACNA1SQ13698 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CACNA1SQ13698 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CACNA1SQ13698 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CACNA1SQ13698 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CACNA1SQ13698 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CACNA1SQ13698 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CACNA1SQ13698 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CACNA1SQ13698 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CACNA1SQ13698 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CACNA1SQ13698 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CACNA1SQ13698 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CACNA1SQ13698 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CACNA1SQ13698 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
CACNA1SQ13698 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CACNA1SQ13698 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
CACNA1SQ13698 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CACNA1SQ13698 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CACNA1SQ13698 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CACNA1SQ13698 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CACNA1SQ13698 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CACNA1SQ13698 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CACNA1SQ13698 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CACNA1SQ13698 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CACNA1SQ13698 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CACNA1SQ13698 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
CACNA1SQ13698 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CACNA1SQ13698 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CACNA1SQ13698 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CACNA1SQ13698 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CACNA1SQ13698 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CACNA1SQ13698 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CACNA1SQ13698 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CACNA1SQ13698 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CACNA1SQ13698 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CACNA1SQ13698 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CACNA1SQ13698 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CACNA1SQ13698 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CACNA1SQ13698 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CACNA1SQ13698 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CACNA1SQ13698 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CACNA1SQ13698 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
CACNA1SQ13698 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
CACNA1SQ13698 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CACNA1SQ13698 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CACNA1SQ13698 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CACNA1SQ13698 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CACNA1SQ13698 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CACNA1SQ13698 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
CACNA1SQ13698 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CACNA1SQ13698 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CACNA1SQ13698 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CACNA1SQ13698 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CACNA1SQ13698 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CACNA1SQ13698 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CACNA1SQ13698 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CACNA1SQ13698 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CACNA1SQ13698 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CACNA1SQ13698 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CACNA1SQ13698 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CACNA1SQ13698 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CACNA1SQ13698 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CACNA1SQ13698 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CACNA1SQ13698 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CACNA1SQ13698 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
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