Protein–RNA interactions for Protein: Q13596

SNX1, Sorting nexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX1Q13596 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX1Q13596 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX1Q13596 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX1Q13596 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX1Q13596 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX1Q13596 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX1Q13596 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX1Q13596 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX1Q13596 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX1Q13596 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX1Q13596 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX1Q13596 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX1Q13596 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX1Q13596 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX1Q13596 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX1Q13596 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNX1Q13596 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNX1Q13596 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNX1Q13596 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNX1Q13596 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SNX1Q13596 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX1Q13596 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX1Q13596 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX1Q13596 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX1Q13596 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX1Q13596 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX1Q13596 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX1Q13596 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX1Q13596 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX1Q13596 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX1Q13596 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX1Q13596 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX1Q13596 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX1Q13596 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX1Q13596 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX1Q13596 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX1Q13596 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX1Q13596 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SNX1Q13596 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNX1Q13596 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNX1Q13596 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNX1Q13596 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNX1Q13596 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNX1Q13596 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNX1Q13596 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX1Q13596 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX1Q13596 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX1Q13596 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX1Q13596 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX1Q13596 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX1Q13596 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX1Q13596 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX1Q13596 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX1Q13596 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX1Q13596 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX1Q13596 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX1Q13596 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX1Q13596 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX1Q13596 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX1Q13596 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX1Q13596 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX1Q13596 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX1Q13596 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX1Q13596 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX1Q13596 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX1Q13596 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX1Q13596 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX1Q13596 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX1Q13596 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX1Q13596 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX1Q13596 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX1Q13596 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX1Q13596 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX1Q13596 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX1Q13596 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX1Q13596 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX1Q13596 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX1Q13596 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX1Q13596 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX1Q13596 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX1Q13596 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX1Q13596 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX1Q13596 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX1Q13596 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SNX1Q13596 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SNX1Q13596 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SNX1Q13596 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SNX1Q13596 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SNX1Q13596 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SNX1Q13596 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNX1Q13596 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNX1Q13596 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNX1Q13596 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNX1Q13596 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX1Q13596 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX1Q13596 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX1Q13596 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX1Q13596 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX1Q13596 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX1Q13596 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
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