Protein–RNA interactions for Protein: Q13595

TRA2A, Transformer-2 protein homolog alpha, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRA2AQ13595 GON4L-203ENST00000368331 7823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.175e-7■■■■□ 23.4
TRA2AQ13595 GON4L-217ENST00000615926 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.25e-7■■■■□ 23.4
TRA2AQ13595 GON4L-219ENST00000622608 4801 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.235e-7■■■■□ 23.4
TRA2AQ13595 GON4L-201ENST00000271883 7138 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.315e-7■■■■□ 23.4
TRA2AQ13595 GON4L-209ENST00000471341 5097 ntTSL 26.62□□□□□ -1.355e-7■■■■□ 23.4
TRA2AQ13595 GON4L-204ENST00000437809 7713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.45e-7■■■■□ 23.4
TRA2AQ13595 SRRT-205ENST00000449389 448 ntTSL 310.73□□□□□ -0.694e-7■■■■□ 23.4
TRA2AQ13595 NASP-212ENST00000527359 743 ntTSL 311.35□□□□□ -0.592e-8■■■■□ 23.4
TRA2AQ13595 NASP-202ENST00000351223 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.843e-8■■■■□ 23.4
TRA2AQ13595 NASP-216ENST00000528238 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 59.11□□□□□ -0.952e-8■■■■□ 23.4
TRA2AQ13595 NASP-201ENST00000350030 3207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.193e-8■■■■□ 23.4
TRA2AQ13595 NASP-224ENST00000537798 3097 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.243e-8■■■■□ 23.4
TRA2AQ13595 NASP-203ENST00000372052 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.263e-8■■■■□ 23.4
TRA2AQ13595 MAP4K4-213ENST00000476609 3598 ntTSL 28.41□□□□□ -1.063e-13■■■■□ 23.4
TRA2AQ13595 MAP4K4-209ENST00000421882 3416 ntTSL 57.38□□□□□ -1.233e-13■■■■□ 23.4
TRA2AQ13595 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.138e-10■■■■□ 23.3
TRA2AQ13595 PRDM2-209ENST00000491134 1100 ntTSL 317.53■□□□□ 0.41e-6■■■■□ 23.3
TRA2AQ13595 ENO2-210ENST00000539713 543 ntTSL 415.98■□□□□ 0.151e-6■■■■□ 23.3
TRA2AQ13595 ENO2-207ENST00000537688 547 ntTSL 515.69■□□□□ 0.11e-6■■■■□ 23.3
TRA2AQ13595 ENO2-212ENST00000542509 825 ntTSL 513.76□□□□□ -0.211e-6■■■■□ 23.3
TRA2AQ13595 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.261e-6■■■■□ 23.3
TRA2AQ13595 ENO2-206ENST00000536199 823 ntTSL 513.18□□□□□ -0.31e-6■■■■□ 23.3
TRA2AQ13595 ENO2-208ENST00000537838 541 ntTSL 413.02□□□□□ -0.331e-6■■■■□ 23.3
TRA2AQ13595 PRDM2-213ENST00000503842 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.381e-6■■■■□ 23.3
TRA2AQ13595 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.411e-6■■■■□ 23.3
TRA2AQ13595 PRDM2-208ENST00000487453 646 ntTSL 312.32□□□□□ -0.441e-6■■■■□ 23.3
TRA2AQ13595 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.471e-6■■■■□ 23.3
TRA2AQ13595 ENO2-214ENST00000545045 1911 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.481e-6■■■■□ 23.3
TRA2AQ13595 PRDM2-214ENST00000505823 568 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.511e-6■■■■□ 23.3
TRA2AQ13595 ENO2-209ENST00000538763 1646 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.531e-6■■■■□ 23.3
TRA2AQ13595 PRDM2-205ENST00000407521 513 ntTSL 411.18□□□□□ -0.621e-6■■■■□ 23.3
TRA2AQ13595 PRDM2-204ENST00000376048 2688 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.81e-6■■■■□ 23.3
TRA2AQ13595 PRDM2-203ENST00000343137 5797 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.21e-6■■■■□ 23.3
TRA2AQ13595 PRDM2-201ENST00000235372 7957 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.331e-6■■■■□ 23.3
TRA2AQ13595 PRDM2-202ENST00000311066 7437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.431e-6■■■■□ 23.3
TRA2AQ13595 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.541e-6■■■■□ 23.3
TRA2AQ13595 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.16e-9■■■■□ 23.3
TRA2AQ13595 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.196e-9■■■■□ 23.3
TRA2AQ13595 PCBP2-201ENST00000359282 1730 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.576e-9■■■■□ 23.3
TRA2AQ13595 PCBP2-208ENST00000546652 823 ntTSL 511.32□□□□□ -0.66e-9■■■■□ 23.3
TRA2AQ13595 PCBP2-226ENST00000562264 1145 ntTSL 510.62□□□□□ -0.716e-9■■■■□ 23.3
TRA2AQ13595 PCBP2-204ENST00000439930 1296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.716e-9■■■■□ 23.3
TRA2AQ13595 PCBP2-217ENST00000550520 753 ntTSL 310.62□□□□□ -0.716e-9■■■■□ 23.3
TRA2AQ13595 AC023509.1-201ENST00000547717 1571 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.86e-9■■■■□ 23.3
TRA2AQ13595 PCBP2-203ENST00000437231 3026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.816e-9■■■■□ 23.3
TRA2AQ13595 PCBP2-223ENST00000552819 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.856e-9■■■■□ 23.3
TRA2AQ13595 PCBP2-207ENST00000546463 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.96e-9■■■■□ 23.3
TRA2AQ13595 PCBP2-206ENST00000455667 2741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.956e-9■■■■□ 23.3
TRA2AQ13595 PCBP2-222ENST00000552296 1342 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.986e-9■■■■□ 23.3
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TRA2AQ13595 PCBP2-213ENST00000548933 1202 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.026e-9■■■■□ 23.3
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TRA2AQ13595 PCBP2-220ENST00000550910 449 ntTSL 34.3□□□□□ -1.726e-9■■■■□ 23.3
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TRA2AQ13595 CCDC136-211ENST00000485998 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 517.43■□□□□ 0.384e-7■■■■□ 23.3
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TRA2AQ13595 UBE2Q2-203ENST00000561723 575 ntTSL 419.38■□□□□ 0.691e-6■■■■□ 23.2
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TRA2AQ13595 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.011e-6■■■■□ 23.2
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TRA2AQ13595 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.492e-12■■■■□ 23.2
TRA2AQ13595 PPFIA1-218ENST00000530932 536 ntTSL 517.57■□□□□ 0.43e-7■■■■□ 23.2
TRA2AQ13595 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.323e-7■■■■□ 23.2
TRA2AQ13595 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.33e-7■■■■□ 23.2
TRA2AQ13595 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.273e-7■■■■□ 23.2
TRA2AQ13595 PPFIA1-222ENST00000532504 5159 ntTSL 1 (best)14.6□□□□□ -0.073e-7■■■■□ 23.2
TRA2AQ13595 GGA3-203ENST00000577435 547 ntTSL 413.72□□□□□ -0.213e-7■■■■□ 23.2
TRA2AQ13595 GGA3-215ENST00000582821 1018 ntTSL 213.72□□□□□ -0.213e-7■■■■□ 23.2
TRA2AQ13595 SCAF4-206ENST00000485790 1282 ntTSL 213.71□□□□□ -0.211e-13■■■■□ 23.2
TRA2AQ13595 GGA3-208ENST00000579743 560 ntTSL 413.66□□□□□ -0.223e-7■■■■□ 23.2
TRA2AQ13595 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.371e-13■■■■□ 23.2
TRA2AQ13595 GGA3-220ENST00000613421 5156 ntTSL 212.33□□□□□ -0.443e-7■■■■□ 23.2
TRA2AQ13595 GGA3-214ENST00000582717 2255 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.483e-7■■■■□ 23.2
TRA2AQ13595 SCAF4-201ENST00000286835 4193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.561e-13■■■■□ 23.2
TRA2AQ13595 GGA3-213ENST00000582486 2319 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.763e-7■■■■□ 23.2
TRA2AQ13595 GGA3-210ENST00000580799 521 ntTSL 510.3□□□□□ -0.763e-7■■■■□ 23.2
TRA2AQ13595 GGA3-205ENST00000578348 2251 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.783e-7■■■■□ 23.2
TRA2AQ13595 GGA3-212ENST00000582376 551 ntTSL 49.37□□□□□ -0.913e-7■■■■□ 23.2
TRA2AQ13595 GGA3-201ENST00000537686 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.963e-7■■■■□ 23.2
TRA2AQ13595 SCAF4-203ENST00000434667 3846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.991e-13■■■■□ 23.2
TRA2AQ13595 CDC73-203ENST00000482484 764 ntTSL 58.49□□□□□ -1.054e-6■■■■□ 23.2
TRA2AQ13595 GGA3-223ENST00000621870 4034 ntTSL 1 (best)8.48□□□□□ -1.053e-7■■■■□ 23.2
TRA2AQ13595 GGA3-202ENST00000538886 3766 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.093e-7■■■■□ 23.2
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