Protein–RNA interactions for Protein: Q13554

CAMK2B, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta, humanhuman

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Length 666 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2BQ13554 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAMK2BQ13554 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAMK2BQ13554 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAMK2BQ13554 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAMK2BQ13554 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CAMK2BQ13554 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CAMK2BQ13554 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CAMK2BQ13554 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAMK2BQ13554 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAMK2BQ13554 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAMK2BQ13554 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAMK2BQ13554 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAMK2BQ13554 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAMK2BQ13554 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAMK2BQ13554 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAMK2BQ13554 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAMK2BQ13554 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAMK2BQ13554 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAMK2BQ13554 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAMK2BQ13554 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAMK2BQ13554 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAMK2BQ13554 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAMK2BQ13554 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CAMK2BQ13554 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAMK2BQ13554 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAMK2BQ13554 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CAMK2BQ13554 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAMK2BQ13554 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAMK2BQ13554 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAMK2BQ13554 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAMK2BQ13554 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAMK2BQ13554 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAMK2BQ13554 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAMK2BQ13554 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAMK2BQ13554 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAMK2BQ13554 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAMK2BQ13554 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAMK2BQ13554 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAMK2BQ13554 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAMK2BQ13554 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CAMK2BQ13554 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAMK2BQ13554 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAMK2BQ13554 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAMK2BQ13554 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAMK2BQ13554 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAMK2BQ13554 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAMK2BQ13554 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAMK2BQ13554 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAMK2BQ13554 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAMK2BQ13554 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAMK2BQ13554 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CAMK2BQ13554 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAMK2BQ13554 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAMK2BQ13554 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAMK2BQ13554 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAMK2BQ13554 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAMK2BQ13554 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAMK2BQ13554 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAMK2BQ13554 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CAMK2BQ13554 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAMK2BQ13554 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAMK2BQ13554 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CAMK2BQ13554 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAMK2BQ13554 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAMK2BQ13554 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAMK2BQ13554 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAMK2BQ13554 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAMK2BQ13554 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAMK2BQ13554 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAMK2BQ13554 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAMK2BQ13554 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CAMK2BQ13554 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CAMK2BQ13554 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAMK2BQ13554 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAMK2BQ13554 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAMK2BQ13554 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAMK2BQ13554 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAMK2BQ13554 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAMK2BQ13554 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAMK2BQ13554 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAMK2BQ13554 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAMK2BQ13554 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAMK2BQ13554 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAMK2BQ13554 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAMK2BQ13554 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CAMK2BQ13554 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAMK2BQ13554 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAMK2BQ13554 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAMK2BQ13554 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAMK2BQ13554 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAMK2BQ13554 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAMK2BQ13554 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAMK2BQ13554 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAMK2BQ13554 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAMK2BQ13554 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAMK2BQ13554 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAMK2BQ13554 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAMK2BQ13554 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAMK2BQ13554 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CAMK2BQ13554 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
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