Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRSF6Q13247 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRSF6Q13247 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRSF6Q13247 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRSF6Q13247 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRSF6Q13247 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRSF6Q13247 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SRSF6Q13247 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRSF6Q13247 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRSF6Q13247 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRSF6Q13247 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRSF6Q13247 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRSF6Q13247 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRSF6Q13247 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRSF6Q13247 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRSF6Q13247 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRSF6Q13247 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRSF6Q13247 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRSF6Q13247 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRSF6Q13247 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRSF6Q13247 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRSF6Q13247 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRSF6Q13247 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRSF6Q13247 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRSF6Q13247 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRSF6Q13247 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SRSF6Q13247 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SRSF6Q13247 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRSF6Q13247 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRSF6Q13247 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRSF6Q13247 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SRSF6Q13247 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRSF6Q13247 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SRSF6Q13247 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRSF6Q13247 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SRSF6Q13247 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRSF6Q13247 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRSF6Q13247 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRSF6Q13247 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRSF6Q13247 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRSF6Q13247 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRSF6Q13247 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRSF6Q13247 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRSF6Q13247 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRSF6Q13247 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRSF6Q13247 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SRSF6Q13247 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRSF6Q13247 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRSF6Q13247 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRSF6Q13247 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRSF6Q13247 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SRSF6Q13247 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRSF6Q13247 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRSF6Q13247 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRSF6Q13247 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRSF6Q13247 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRSF6Q13247 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRSF6Q13247 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRSF6Q13247 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRSF6Q13247 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SRSF6Q13247 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRSF6Q13247 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRSF6Q13247 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRSF6Q13247 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRSF6Q13247 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRSF6Q13247 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRSF6Q13247 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRSF6Q13247 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRSF6Q13247 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRSF6Q13247 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRSF6Q13247 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRSF6Q13247 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRSF6Q13247 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRSF6Q13247 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRSF6Q13247 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRSF6Q13247 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRSF6Q13247 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SRSF6Q13247 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRSF6Q13247 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SRSF6Q13247 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRSF6Q13247 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRSF6Q13247 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRSF6Q13247 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRSF6Q13247 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRSF6Q13247 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRSF6Q13247 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SRSF6Q13247 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRSF6Q13247 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRSF6Q13247 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRSF6Q13247 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRSF6Q13247 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRSF6Q13247 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRSF6Q13247 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRSF6Q13247 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRSF6Q13247 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRSF6Q13247 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRSF6Q13247 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRSF6Q13247 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRSF6Q13247 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRSF6Q13247 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
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