Protein–RNA interactions for Protein: Q13136

PPFIA1, Liprin-alpha-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA1Q13136 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PPFIA1Q13136 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PPFIA1Q13136 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PPFIA1Q13136 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PPFIA1Q13136 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PPFIA1Q13136 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PPFIA1Q13136 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PPFIA1Q13136 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PPFIA1Q13136 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PPFIA1Q13136 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PPFIA1Q13136 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PPFIA1Q13136 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PPFIA1Q13136 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PPFIA1Q13136 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PPFIA1Q13136 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PPFIA1Q13136 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PPFIA1Q13136 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PPFIA1Q13136 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PPFIA1Q13136 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PPFIA1Q13136 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PPFIA1Q13136 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PPFIA1Q13136 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PPFIA1Q13136 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PPFIA1Q13136 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PPFIA1Q13136 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PPFIA1Q13136 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
PPFIA1Q13136 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
PPFIA1Q13136 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PPFIA1Q13136 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PPFIA1Q13136 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PPFIA1Q13136 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PPFIA1Q13136 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PPFIA1Q13136 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PPFIA1Q13136 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PPFIA1Q13136 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PPFIA1Q13136 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PPFIA1Q13136 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PPFIA1Q13136 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PPFIA1Q13136 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PPFIA1Q13136 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PPFIA1Q13136 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PPFIA1Q13136 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PPFIA1Q13136 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PPFIA1Q13136 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PPFIA1Q13136 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PPFIA1Q13136 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PPFIA1Q13136 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PPFIA1Q13136 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PPFIA1Q13136 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PPFIA1Q13136 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PPFIA1Q13136 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PPFIA1Q13136 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PPFIA1Q13136 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PPFIA1Q13136 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PPFIA1Q13136 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PPFIA1Q13136 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PPFIA1Q13136 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PPFIA1Q13136 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PPFIA1Q13136 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PPFIA1Q13136 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PPFIA1Q13136 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PPFIA1Q13136 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PPFIA1Q13136 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PPFIA1Q13136 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PPFIA1Q13136 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PPFIA1Q13136 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PPFIA1Q13136 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PPFIA1Q13136 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PPFIA1Q13136 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PPFIA1Q13136 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PPFIA1Q13136 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PPFIA1Q13136 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PPFIA1Q13136 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PPFIA1Q13136 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PPFIA1Q13136 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PPFIA1Q13136 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PPFIA1Q13136 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PPFIA1Q13136 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PPFIA1Q13136 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PPFIA1Q13136 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PPFIA1Q13136 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PPFIA1Q13136 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PPFIA1Q13136 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PPFIA1Q13136 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PPFIA1Q13136 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PPFIA1Q13136 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PPFIA1Q13136 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PPFIA1Q13136 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PPFIA1Q13136 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PPFIA1Q13136 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PPFIA1Q13136 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PPFIA1Q13136 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PPFIA1Q13136 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PPFIA1Q13136 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PPFIA1Q13136 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PPFIA1Q13136 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PPFIA1Q13136 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PPFIA1Q13136 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PPFIA1Q13136 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PPFIA1Q13136 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
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