Protein–RNA interactions for Protein: Q13127

REST, RE1-silencing transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RESTQ13127 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RESTQ13127 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RESTQ13127 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RESTQ13127 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RESTQ13127 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RESTQ13127 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RESTQ13127 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RESTQ13127 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RESTQ13127 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RESTQ13127 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RESTQ13127 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RESTQ13127 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RESTQ13127 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RESTQ13127 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RESTQ13127 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RESTQ13127 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RESTQ13127 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RESTQ13127 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RESTQ13127 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RESTQ13127 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RESTQ13127 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RESTQ13127 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RESTQ13127 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RESTQ13127 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RESTQ13127 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RESTQ13127 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RESTQ13127 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RESTQ13127 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RESTQ13127 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RESTQ13127 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RESTQ13127 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RESTQ13127 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RESTQ13127 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RESTQ13127 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RESTQ13127 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RESTQ13127 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RESTQ13127 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RESTQ13127 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RESTQ13127 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RESTQ13127 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RESTQ13127 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RESTQ13127 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RESTQ13127 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RESTQ13127 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RESTQ13127 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RESTQ13127 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RESTQ13127 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
RESTQ13127 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
RESTQ13127 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
RESTQ13127 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
RESTQ13127 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RESTQ13127 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RESTQ13127 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RESTQ13127 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RESTQ13127 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RESTQ13127 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RESTQ13127 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RESTQ13127 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RESTQ13127 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RESTQ13127 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RESTQ13127 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RESTQ13127 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RESTQ13127 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RESTQ13127 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
RESTQ13127 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RESTQ13127 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RESTQ13127 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RESTQ13127 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RESTQ13127 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RESTQ13127 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
RESTQ13127 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RESTQ13127 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RESTQ13127 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RESTQ13127 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RESTQ13127 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RESTQ13127 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RESTQ13127 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RESTQ13127 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RESTQ13127 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RESTQ13127 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RESTQ13127 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RESTQ13127 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RESTQ13127 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RESTQ13127 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RESTQ13127 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RESTQ13127 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RESTQ13127 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RESTQ13127 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RESTQ13127 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RESTQ13127 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RESTQ13127 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RESTQ13127 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RESTQ13127 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RESTQ13127 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RESTQ13127 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RESTQ13127 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RESTQ13127 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
RESTQ13127 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RESTQ13127 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RESTQ13127 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
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