Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAF3Q13114 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAF3Q13114 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAF3Q13114 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAF3Q13114 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAF3Q13114 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAF3Q13114 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAF3Q13114 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAF3Q13114 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAF3Q13114 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAF3Q13114 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAF3Q13114 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAF3Q13114 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAF3Q13114 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAF3Q13114 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAF3Q13114 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAF3Q13114 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAF3Q13114 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAF3Q13114 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAF3Q13114 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAF3Q13114 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAF3Q13114 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAF3Q13114 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAF3Q13114 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAF3Q13114 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAF3Q13114 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAF3Q13114 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAF3Q13114 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAF3Q13114 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAF3Q13114 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAF3Q13114 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAF3Q13114 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAF3Q13114 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAF3Q13114 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAF3Q13114 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAF3Q13114 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAF3Q13114 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAF3Q13114 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAF3Q13114 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAF3Q13114 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAF3Q13114 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAF3Q13114 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAF3Q13114 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAF3Q13114 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAF3Q13114 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAF3Q13114 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAF3Q13114 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAF3Q13114 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAF3Q13114 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAF3Q13114 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAF3Q13114 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAF3Q13114 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAF3Q13114 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAF3Q13114 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAF3Q13114 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRAF3Q13114 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAF3Q13114 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAF3Q13114 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAF3Q13114 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAF3Q13114 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAF3Q13114 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAF3Q13114 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAF3Q13114 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAF3Q13114 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAF3Q13114 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAF3Q13114 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAF3Q13114 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAF3Q13114 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAF3Q13114 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAF3Q13114 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAF3Q13114 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAF3Q13114 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAF3Q13114 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAF3Q13114 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAF3Q13114 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAF3Q13114 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAF3Q13114 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAF3Q13114 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAF3Q13114 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAF3Q13114 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAF3Q13114 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAF3Q13114 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAF3Q13114 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAF3Q13114 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAF3Q13114 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAF3Q13114 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAF3Q13114 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAF3Q13114 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAF3Q13114 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAF3Q13114 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAF3Q13114 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAF3Q13114 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAF3Q13114 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAF3Q13114 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAF3Q13114 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAF3Q13114 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAF3Q13114 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAF3Q13114 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAF3Q13114 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAF3Q13114 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
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