Protein–RNA interactions for Protein: Q13042

CDC16, Cell division cycle protein 16 homolog, humanhuman

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Length 620 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC16Q13042 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDC16Q13042 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDC16Q13042 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDC16Q13042 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDC16Q13042 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDC16Q13042 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDC16Q13042 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDC16Q13042 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDC16Q13042 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDC16Q13042 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CDC16Q13042 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDC16Q13042 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDC16Q13042 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDC16Q13042 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDC16Q13042 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDC16Q13042 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDC16Q13042 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDC16Q13042 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDC16Q13042 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDC16Q13042 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDC16Q13042 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDC16Q13042 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDC16Q13042 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDC16Q13042 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDC16Q13042 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDC16Q13042 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDC16Q13042 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CDC16Q13042 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDC16Q13042 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDC16Q13042 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDC16Q13042 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDC16Q13042 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDC16Q13042 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDC16Q13042 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDC16Q13042 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDC16Q13042 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDC16Q13042 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDC16Q13042 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDC16Q13042 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDC16Q13042 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDC16Q13042 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDC16Q13042 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CDC16Q13042 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDC16Q13042 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CDC16Q13042 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CDC16Q13042 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDC16Q13042 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDC16Q13042 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDC16Q13042 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDC16Q13042 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDC16Q13042 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDC16Q13042 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDC16Q13042 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDC16Q13042 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDC16Q13042 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDC16Q13042 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDC16Q13042 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDC16Q13042 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDC16Q13042 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDC16Q13042 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDC16Q13042 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDC16Q13042 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDC16Q13042 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDC16Q13042 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDC16Q13042 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDC16Q13042 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDC16Q13042 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDC16Q13042 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDC16Q13042 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDC16Q13042 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDC16Q13042 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDC16Q13042 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDC16Q13042 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDC16Q13042 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDC16Q13042 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDC16Q13042 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDC16Q13042 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDC16Q13042 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDC16Q13042 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDC16Q13042 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDC16Q13042 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDC16Q13042 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDC16Q13042 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDC16Q13042 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDC16Q13042 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDC16Q13042 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CDC16Q13042 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDC16Q13042 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDC16Q13042 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDC16Q13042 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDC16Q13042 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDC16Q13042 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDC16Q13042 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDC16Q13042 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDC16Q13042 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDC16Q13042 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDC16Q13042 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDC16Q13042 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDC16Q13042 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CDC16Q13042 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
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