Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMARCB1Q12824 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMARCB1Q12824 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMARCB1Q12824 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMARCB1Q12824 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMARCB1Q12824 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMARCB1Q12824 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMARCB1Q12824 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMARCB1Q12824 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMARCB1Q12824 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMARCB1Q12824 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMARCB1Q12824 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMARCB1Q12824 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMARCB1Q12824 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMARCB1Q12824 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMARCB1Q12824 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMARCB1Q12824 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMARCB1Q12824 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMARCB1Q12824 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMARCB1Q12824 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMARCB1Q12824 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMARCB1Q12824 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMARCB1Q12824 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SMARCB1Q12824 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMARCB1Q12824 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMARCB1Q12824 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCB1Q12824 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCB1Q12824 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCB1Q12824 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCB1Q12824 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCB1Q12824 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCB1Q12824 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMARCB1Q12824 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMARCB1Q12824 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMARCB1Q12824 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMARCB1Q12824 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMARCB1Q12824 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCB1Q12824 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCB1Q12824 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCB1Q12824 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCB1Q12824 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCB1Q12824 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMARCB1Q12824 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMARCB1Q12824 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMARCB1Q12824 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMARCB1Q12824 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMARCB1Q12824 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMARCB1Q12824 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMARCB1Q12824 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SMARCB1Q12824 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMARCB1Q12824 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMARCB1Q12824 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMARCB1Q12824 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMARCB1Q12824 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMARCB1Q12824 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SMARCB1Q12824 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMARCB1Q12824 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMARCB1Q12824 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMARCB1Q12824 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SMARCB1Q12824 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SMARCB1Q12824 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMARCB1Q12824 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMARCB1Q12824 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMARCB1Q12824 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMARCB1Q12824 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMARCB1Q12824 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMARCB1Q12824 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMARCB1Q12824 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMARCB1Q12824 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMARCB1Q12824 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMARCB1Q12824 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SMARCB1Q12824 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMARCB1Q12824 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMARCB1Q12824 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMARCB1Q12824 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMARCB1Q12824 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMARCB1Q12824 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMARCB1Q12824 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMARCB1Q12824 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMARCB1Q12824 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMARCB1Q12824 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMARCB1Q12824 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMARCB1Q12824 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMARCB1Q12824 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMARCB1Q12824 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMARCB1Q12824 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SMARCB1Q12824 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMARCB1Q12824 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SMARCB1Q12824 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMARCB1Q12824 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMARCB1Q12824 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMARCB1Q12824 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SMARCB1Q12824 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMARCB1Q12824 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMARCB1Q12824 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMARCB1Q12824 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMARCB1Q12824 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMARCB1Q12824 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMARCB1Q12824 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMARCB1Q12824 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
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