Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
TROQ12816 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
TROQ12816 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
TROQ12816 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
TROQ12816 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
TROQ12816 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC36.85■■■■□ 3.49
TROQ12816 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC36.85■■■■□ 3.49
TROQ12816 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
TROQ12816 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
TROQ12816 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
TROQ12816 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
TROQ12816 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
TROQ12816 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
TROQ12816 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
TROQ12816 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC36.84■■■■□ 3.49
TROQ12816 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
TROQ12816 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
TROQ12816 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.48
TROQ12816 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC36.82■■■■□ 3.48
TROQ12816 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
TROQ12816 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC36.82■■■■□ 3.48
TROQ12816 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
TROQ12816 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
TROQ12816 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
TROQ12816 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
TROQ12816 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
TROQ12816 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
TROQ12816 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
TROQ12816 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
TROQ12816 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC36.79■■■■□ 3.48
TROQ12816 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC36.79■■■■□ 3.48
TROQ12816 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
TROQ12816 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
TROQ12816 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
TROQ12816 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
TROQ12816 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
TROQ12816 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
TROQ12816 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC36.78■■■■□ 3.48
TROQ12816 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
TROQ12816 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
TROQ12816 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
TROQ12816 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
TROQ12816 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
TROQ12816 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
TROQ12816 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
TROQ12816 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
TROQ12816 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
TROQ12816 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
TROQ12816 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC36.75■■■■□ 3.47
TROQ12816 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
TROQ12816 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
TROQ12816 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
TROQ12816 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
TROQ12816 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
TROQ12816 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
TROQ12816 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC36.73■■■■□ 3.47
TROQ12816 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
TROQ12816 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
TROQ12816 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
TROQ12816 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
TROQ12816 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
TROQ12816 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC36.73■■■■□ 3.47
TROQ12816 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
TROQ12816 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
TROQ12816 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
TROQ12816 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
TROQ12816 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
TROQ12816 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
TROQ12816 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
TROQ12816 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
TROQ12816 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC36.71■■■■□ 3.47
TROQ12816 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
TROQ12816 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
TROQ12816 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
TROQ12816 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
TROQ12816 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
TROQ12816 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
TROQ12816 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
TROQ12816 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
TROQ12816 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
TROQ12816 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
TROQ12816 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
TROQ12816 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
TROQ12816 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
TROQ12816 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
TROQ12816 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
TROQ12816 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
TROQ12816 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
TROQ12816 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
TROQ12816 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
TROQ12816 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
TROQ12816 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
TROQ12816 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
TROQ12816 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
TROQ12816 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
TROQ12816 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
TROQ12816 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
TROQ12816 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
TROQ12816 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
TROQ12816 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
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