Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCNMA1Q12791 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCNMA1Q12791 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCNMA1Q12791 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCNMA1Q12791 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCNMA1Q12791 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCNMA1Q12791 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCNMA1Q12791 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KCNMA1Q12791 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KCNMA1Q12791 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KCNMA1Q12791 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KCNMA1Q12791 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KCNMA1Q12791 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KCNMA1Q12791 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
KCNMA1Q12791 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KCNMA1Q12791 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KCNMA1Q12791 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KCNMA1Q12791 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KCNMA1Q12791 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
KCNMA1Q12791 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
KCNMA1Q12791 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KCNMA1Q12791 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KCNMA1Q12791 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KCNMA1Q12791 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KCNMA1Q12791 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
KCNMA1Q12791 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KCNMA1Q12791 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KCNMA1Q12791 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KCNMA1Q12791 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KCNMA1Q12791 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KCNMA1Q12791 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
KCNMA1Q12791 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
KCNMA1Q12791 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KCNMA1Q12791 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KCNMA1Q12791 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KCNMA1Q12791 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KCNMA1Q12791 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KCNMA1Q12791 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KCNMA1Q12791 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KCNMA1Q12791 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KCNMA1Q12791 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KCNMA1Q12791 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KCNMA1Q12791 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KCNMA1Q12791 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KCNMA1Q12791 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
KCNMA1Q12791 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KCNMA1Q12791 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KCNMA1Q12791 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KCNMA1Q12791 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KCNMA1Q12791 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KCNMA1Q12791 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KCNMA1Q12791 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KCNMA1Q12791 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KCNMA1Q12791 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KCNMA1Q12791 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KCNMA1Q12791 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KCNMA1Q12791 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KCNMA1Q12791 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KCNMA1Q12791 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KCNMA1Q12791 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KCNMA1Q12791 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KCNMA1Q12791 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KCNMA1Q12791 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
KCNMA1Q12791 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KCNMA1Q12791 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KCNMA1Q12791 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KCNMA1Q12791 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KCNMA1Q12791 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KCNMA1Q12791 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KCNMA1Q12791 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KCNMA1Q12791 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KCNMA1Q12791 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KCNMA1Q12791 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KCNMA1Q12791 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KCNMA1Q12791 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KCNMA1Q12791 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KCNMA1Q12791 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KCNMA1Q12791 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KCNMA1Q12791 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KCNMA1Q12791 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KCNMA1Q12791 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KCNMA1Q12791 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KCNMA1Q12791 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KCNMA1Q12791 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KCNMA1Q12791 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KCNMA1Q12791 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KCNMA1Q12791 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KCNMA1Q12791 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KCNMA1Q12791 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KCNMA1Q12791 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KCNMA1Q12791 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
KCNMA1Q12791 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
KCNMA1Q12791 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KCNMA1Q12791 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KCNMA1Q12791 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KCNMA1Q12791 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KCNMA1Q12791 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KCNMA1Q12791 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KCNMA1Q12791 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KCNMA1Q12791 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
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