Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PDE4BQ07343 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PDE4BQ07343 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PDE4BQ07343 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PDE4BQ07343 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PDE4BQ07343 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PDE4BQ07343 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PDE4BQ07343 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PDE4BQ07343 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PDE4BQ07343 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PDE4BQ07343 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PDE4BQ07343 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PDE4BQ07343 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PDE4BQ07343 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PDE4BQ07343 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PDE4BQ07343 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PDE4BQ07343 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PDE4BQ07343 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PDE4BQ07343 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PDE4BQ07343 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PDE4BQ07343 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PDE4BQ07343 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PDE4BQ07343 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
PDE4BQ07343 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PDE4BQ07343 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDE4BQ07343 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDE4BQ07343 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDE4BQ07343 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDE4BQ07343 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDE4BQ07343 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDE4BQ07343 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDE4BQ07343 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PDE4BQ07343 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PDE4BQ07343 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
PDE4BQ07343 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PDE4BQ07343 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PDE4BQ07343 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDE4BQ07343 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDE4BQ07343 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDE4BQ07343 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PDE4BQ07343 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PDE4BQ07343 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PDE4BQ07343 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PDE4BQ07343 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDE4BQ07343 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDE4BQ07343 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDE4BQ07343 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDE4BQ07343 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDE4BQ07343 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDE4BQ07343 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDE4BQ07343 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDE4BQ07343 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDE4BQ07343 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDE4BQ07343 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDE4BQ07343 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PDE4BQ07343 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PDE4BQ07343 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDE4BQ07343 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDE4BQ07343 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDE4BQ07343 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDE4BQ07343 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDE4BQ07343 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDE4BQ07343 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDE4BQ07343 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PDE4BQ07343 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PDE4BQ07343 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PDE4BQ07343 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PDE4BQ07343 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PDE4BQ07343 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PDE4BQ07343 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PDE4BQ07343 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PDE4BQ07343 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PDE4BQ07343 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PDE4BQ07343 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PDE4BQ07343 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PDE4BQ07343 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PDE4BQ07343 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PDE4BQ07343 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PDE4BQ07343 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PDE4BQ07343 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PDE4BQ07343 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PDE4BQ07343 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PDE4BQ07343 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PDE4BQ07343 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PDE4BQ07343 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PDE4BQ07343 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PDE4BQ07343 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PDE4BQ07343 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PDE4BQ07343 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PDE4BQ07343 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PDE4BQ07343 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PDE4BQ07343 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PDE4BQ07343 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PDE4BQ07343 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PDE4BQ07343 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDE4BQ07343 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDE4BQ07343 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDE4BQ07343 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PDE4BQ07343 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PDE4BQ07343 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms