Protein–RNA interactions for Protein: P78549

NTHL1, Endonuclease III-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTHL1P78549 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NTHL1P78549 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NTHL1P78549 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NTHL1P78549 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NTHL1P78549 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NTHL1P78549 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NTHL1P78549 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NTHL1P78549 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NTHL1P78549 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NTHL1P78549 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NTHL1P78549 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NTHL1P78549 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NTHL1P78549 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NTHL1P78549 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NTHL1P78549 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NTHL1P78549 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NTHL1P78549 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NTHL1P78549 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NTHL1P78549 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NTHL1P78549 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NTHL1P78549 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NTHL1P78549 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NTHL1P78549 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NTHL1P78549 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NTHL1P78549 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NTHL1P78549 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NTHL1P78549 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NTHL1P78549 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NTHL1P78549 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NTHL1P78549 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NTHL1P78549 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NTHL1P78549 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NTHL1P78549 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NTHL1P78549 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NTHL1P78549 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NTHL1P78549 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NTHL1P78549 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NTHL1P78549 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NTHL1P78549 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NTHL1P78549 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NTHL1P78549 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NTHL1P78549 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NTHL1P78549 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NTHL1P78549 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NTHL1P78549 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NTHL1P78549 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NTHL1P78549 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NTHL1P78549 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NTHL1P78549 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NTHL1P78549 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NTHL1P78549 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NTHL1P78549 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NTHL1P78549 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NTHL1P78549 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NTHL1P78549 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NTHL1P78549 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NTHL1P78549 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NTHL1P78549 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NTHL1P78549 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NTHL1P78549 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NTHL1P78549 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NTHL1P78549 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NTHL1P78549 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NTHL1P78549 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NTHL1P78549 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NTHL1P78549 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NTHL1P78549 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NTHL1P78549 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NTHL1P78549 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NTHL1P78549 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NTHL1P78549 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NTHL1P78549 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NTHL1P78549 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NTHL1P78549 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NTHL1P78549 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NTHL1P78549 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NTHL1P78549 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NTHL1P78549 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NTHL1P78549 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NTHL1P78549 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NTHL1P78549 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NTHL1P78549 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NTHL1P78549 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NTHL1P78549 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NTHL1P78549 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NTHL1P78549 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NTHL1P78549 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NTHL1P78549 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NTHL1P78549 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NTHL1P78549 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NTHL1P78549 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NTHL1P78549 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NTHL1P78549 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NTHL1P78549 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NTHL1P78549 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NTHL1P78549 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NTHL1P78549 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NTHL1P78549 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NTHL1P78549 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NTHL1P78549 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms