Protein–RNA interactions for Protein: P62979

RPS27A, Ubiquitin-40S ribosomal protein S27a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS27AP62979 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPS27AP62979 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPS27AP62979 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPS27AP62979 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPS27AP62979 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPS27AP62979 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPS27AP62979 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPS27AP62979 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPS27AP62979 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPS27AP62979 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPS27AP62979 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPS27AP62979 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPS27AP62979 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPS27AP62979 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPS27AP62979 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPS27AP62979 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
RPS27AP62979 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPS27AP62979 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPS27AP62979 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPS27AP62979 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPS27AP62979 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPS27AP62979 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPS27AP62979 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPS27AP62979 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPS27AP62979 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPS27AP62979 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPS27AP62979 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPS27AP62979 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPS27AP62979 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPS27AP62979 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPS27AP62979 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPS27AP62979 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPS27AP62979 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPS27AP62979 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPS27AP62979 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RPS27AP62979 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPS27AP62979 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RPS27AP62979 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPS27AP62979 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPS27AP62979 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPS27AP62979 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPS27AP62979 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPS27AP62979 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPS27AP62979 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPS27AP62979 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPS27AP62979 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPS27AP62979 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPS27AP62979 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPS27AP62979 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPS27AP62979 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPS27AP62979 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPS27AP62979 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPS27AP62979 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPS27AP62979 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPS27AP62979 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPS27AP62979 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPS27AP62979 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPS27AP62979 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPS27AP62979 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPS27AP62979 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPS27AP62979 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPS27AP62979 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPS27AP62979 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPS27AP62979 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPS27AP62979 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPS27AP62979 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPS27AP62979 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPS27AP62979 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPS27AP62979 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPS27AP62979 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPS27AP62979 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPS27AP62979 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPS27AP62979 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPS27AP62979 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPS27AP62979 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPS27AP62979 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPS27AP62979 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPS27AP62979 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPS27AP62979 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RPS27AP62979 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPS27AP62979 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPS27AP62979 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RPS27AP62979 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPS27AP62979 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPS27AP62979 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPS27AP62979 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RPS27AP62979 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPS27AP62979 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPS27AP62979 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPS27AP62979 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPS27AP62979 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPS27AP62979 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPS27AP62979 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPS27AP62979 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPS27AP62979 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RPS27AP62979 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPS27AP62979 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPS27AP62979 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPS27AP62979 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPS27AP62979 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms