Protein–RNA interactions for Protein: P60228

EIF3E, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3EP60228 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EIF3EP60228 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EIF3EP60228 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
EIF3EP60228 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
EIF3EP60228 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EIF3EP60228 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EIF3EP60228 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EIF3EP60228 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EIF3EP60228 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EIF3EP60228 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EIF3EP60228 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EIF3EP60228 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EIF3EP60228 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EIF3EP60228 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EIF3EP60228 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EIF3EP60228 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EIF3EP60228 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EIF3EP60228 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
EIF3EP60228 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EIF3EP60228 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EIF3EP60228 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EIF3EP60228 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EIF3EP60228 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EIF3EP60228 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EIF3EP60228 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EIF3EP60228 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EIF3EP60228 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EIF3EP60228 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EIF3EP60228 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EIF3EP60228 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EIF3EP60228 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EIF3EP60228 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EIF3EP60228 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EIF3EP60228 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EIF3EP60228 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EIF3EP60228 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
EIF3EP60228 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EIF3EP60228 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EIF3EP60228 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EIF3EP60228 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EIF3EP60228 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EIF3EP60228 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
EIF3EP60228 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EIF3EP60228 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EIF3EP60228 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EIF3EP60228 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EIF3EP60228 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EIF3EP60228 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EIF3EP60228 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EIF3EP60228 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EIF3EP60228 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EIF3EP60228 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EIF3EP60228 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EIF3EP60228 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EIF3EP60228 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EIF3EP60228 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EIF3EP60228 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EIF3EP60228 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EIF3EP60228 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EIF3EP60228 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EIF3EP60228 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EIF3EP60228 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EIF3EP60228 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EIF3EP60228 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EIF3EP60228 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EIF3EP60228 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EIF3EP60228 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EIF3EP60228 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EIF3EP60228 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EIF3EP60228 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EIF3EP60228 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EIF3EP60228 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EIF3EP60228 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EIF3EP60228 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EIF3EP60228 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EIF3EP60228 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EIF3EP60228 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EIF3EP60228 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EIF3EP60228 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EIF3EP60228 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EIF3EP60228 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EIF3EP60228 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EIF3EP60228 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EIF3EP60228 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
EIF3EP60228 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EIF3EP60228 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EIF3EP60228 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EIF3EP60228 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EIF3EP60228 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EIF3EP60228 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
EIF3EP60228 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
EIF3EP60228 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EIF3EP60228 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EIF3EP60228 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EIF3EP60228 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EIF3EP60228 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EIF3EP60228 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EIF3EP60228 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EIF3EP60228 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EIF3EP60228 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms