Protein–RNA interactions for Protein: P57764

GSDMD, Gasdermin-D, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMDP57764 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GSDMDP57764 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GSDMDP57764 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GSDMDP57764 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GSDMDP57764 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GSDMDP57764 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GSDMDP57764 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GSDMDP57764 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GSDMDP57764 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GSDMDP57764 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GSDMDP57764 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GSDMDP57764 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GSDMDP57764 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
GSDMDP57764 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GSDMDP57764 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GSDMDP57764 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GSDMDP57764 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GSDMDP57764 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GSDMDP57764 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GSDMDP57764 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GSDMDP57764 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GSDMDP57764 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GSDMDP57764 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GSDMDP57764 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GSDMDP57764 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GSDMDP57764 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GSDMDP57764 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GSDMDP57764 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GSDMDP57764 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GSDMDP57764 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GSDMDP57764 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GSDMDP57764 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GSDMDP57764 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GSDMDP57764 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GSDMDP57764 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
GSDMDP57764 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GSDMDP57764 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GSDMDP57764 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GSDMDP57764 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GSDMDP57764 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GSDMDP57764 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GSDMDP57764 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
GSDMDP57764 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GSDMDP57764 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GSDMDP57764 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GSDMDP57764 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
GSDMDP57764 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
GSDMDP57764 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GSDMDP57764 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GSDMDP57764 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GSDMDP57764 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GSDMDP57764 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GSDMDP57764 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GSDMDP57764 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GSDMDP57764 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GSDMDP57764 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GSDMDP57764 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GSDMDP57764 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GSDMDP57764 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GSDMDP57764 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GSDMDP57764 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GSDMDP57764 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
GSDMDP57764 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GSDMDP57764 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GSDMDP57764 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GSDMDP57764 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GSDMDP57764 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GSDMDP57764 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GSDMDP57764 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GSDMDP57764 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GSDMDP57764 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GSDMDP57764 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GSDMDP57764 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GSDMDP57764 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GSDMDP57764 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GSDMDP57764 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GSDMDP57764 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GSDMDP57764 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GSDMDP57764 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GSDMDP57764 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GSDMDP57764 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GSDMDP57764 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GSDMDP57764 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GSDMDP57764 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
GSDMDP57764 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
GSDMDP57764 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GSDMDP57764 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GSDMDP57764 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GSDMDP57764 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GSDMDP57764 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GSDMDP57764 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GSDMDP57764 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GSDMDP57764 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GSDMDP57764 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GSDMDP57764 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
GSDMDP57764 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
GSDMDP57764 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
GSDMDP57764 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
GSDMDP57764 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
GSDMDP57764 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms