Protein–RNA interactions for Protein: P56975

NRG3, Pro-neuregulin-3, membrane-bound isoform, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRG3P56975 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NRG3P56975 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NRG3P56975 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NRG3P56975 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NRG3P56975 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NRG3P56975 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NRG3P56975 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NRG3P56975 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NRG3P56975 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NRG3P56975 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NRG3P56975 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NRG3P56975 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NRG3P56975 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NRG3P56975 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NRG3P56975 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NRG3P56975 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NRG3P56975 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NRG3P56975 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NRG3P56975 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NRG3P56975 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NRG3P56975 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NRG3P56975 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NRG3P56975 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NRG3P56975 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NRG3P56975 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NRG3P56975 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NRG3P56975 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NRG3P56975 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NRG3P56975 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NRG3P56975 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NRG3P56975 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NRG3P56975 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NRG3P56975 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NRG3P56975 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NRG3P56975 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NRG3P56975 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NRG3P56975 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NRG3P56975 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NRG3P56975 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NRG3P56975 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NRG3P56975 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NRG3P56975 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NRG3P56975 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NRG3P56975 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NRG3P56975 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NRG3P56975 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NRG3P56975 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NRG3P56975 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NRG3P56975 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NRG3P56975 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NRG3P56975 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NRG3P56975 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NRG3P56975 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NRG3P56975 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NRG3P56975 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NRG3P56975 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NRG3P56975 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NRG3P56975 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NRG3P56975 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NRG3P56975 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NRG3P56975 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NRG3P56975 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NRG3P56975 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NRG3P56975 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NRG3P56975 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NRG3P56975 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NRG3P56975 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NRG3P56975 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NRG3P56975 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NRG3P56975 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NRG3P56975 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NRG3P56975 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NRG3P56975 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NRG3P56975 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NRG3P56975 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NRG3P56975 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NRG3P56975 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NRG3P56975 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NRG3P56975 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NRG3P56975 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NRG3P56975 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NRG3P56975 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NRG3P56975 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NRG3P56975 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NRG3P56975 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NRG3P56975 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NRG3P56975 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NRG3P56975 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NRG3P56975 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NRG3P56975 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NRG3P56975 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NRG3P56975 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
NRG3P56975 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NRG3P56975 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NRG3P56975 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
NRG3P56975 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NRG3P56975 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NRG3P56975 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NRG3P56975 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NRG3P56975 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms