Protein–RNA interactions for Protein: P56159

GFRA1, GDNF family receptor alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA1P56159 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GFRA1P56159 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GFRA1P56159 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GFRA1P56159 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GFRA1P56159 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GFRA1P56159 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GFRA1P56159 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GFRA1P56159 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GFRA1P56159 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GFRA1P56159 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GFRA1P56159 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GFRA1P56159 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GFRA1P56159 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GFRA1P56159 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GFRA1P56159 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GFRA1P56159 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GFRA1P56159 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GFRA1P56159 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GFRA1P56159 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GFRA1P56159 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GFRA1P56159 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GFRA1P56159 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GFRA1P56159 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GFRA1P56159 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GFRA1P56159 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
GFRA1P56159 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GFRA1P56159 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GFRA1P56159 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GFRA1P56159 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GFRA1P56159 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GFRA1P56159 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GFRA1P56159 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GFRA1P56159 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GFRA1P56159 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GFRA1P56159 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GFRA1P56159 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GFRA1P56159 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GFRA1P56159 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GFRA1P56159 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GFRA1P56159 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GFRA1P56159 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GFRA1P56159 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GFRA1P56159 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GFRA1P56159 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GFRA1P56159 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GFRA1P56159 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GFRA1P56159 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GFRA1P56159 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GFRA1P56159 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GFRA1P56159 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GFRA1P56159 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GFRA1P56159 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GFRA1P56159 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GFRA1P56159 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GFRA1P56159 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GFRA1P56159 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GFRA1P56159 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GFRA1P56159 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GFRA1P56159 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
GFRA1P56159 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GFRA1P56159 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GFRA1P56159 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GFRA1P56159 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GFRA1P56159 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
GFRA1P56159 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GFRA1P56159 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GFRA1P56159 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
GFRA1P56159 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GFRA1P56159 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GFRA1P56159 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GFRA1P56159 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GFRA1P56159 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GFRA1P56159 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GFRA1P56159 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GFRA1P56159 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GFRA1P56159 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GFRA1P56159 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
GFRA1P56159 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GFRA1P56159 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GFRA1P56159 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GFRA1P56159 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GFRA1P56159 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GFRA1P56159 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GFRA1P56159 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GFRA1P56159 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GFRA1P56159 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GFRA1P56159 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GFRA1P56159 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GFRA1P56159 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GFRA1P56159 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
GFRA1P56159 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GFRA1P56159 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GFRA1P56159 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GFRA1P56159 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
GFRA1P56159 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GFRA1P56159 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GFRA1P56159 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GFRA1P56159 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GFRA1P56159 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GFRA1P56159 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms