Protein–RNA interactions for Protein: P55287

CDH11, Cadherin-11, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH11P55287 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDH11P55287 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDH11P55287 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDH11P55287 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDH11P55287 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDH11P55287 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDH11P55287 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDH11P55287 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDH11P55287 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDH11P55287 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDH11P55287 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDH11P55287 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDH11P55287 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDH11P55287 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDH11P55287 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDH11P55287 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDH11P55287 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDH11P55287 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDH11P55287 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDH11P55287 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CDH11P55287 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CDH11P55287 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDH11P55287 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDH11P55287 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDH11P55287 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDH11P55287 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDH11P55287 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDH11P55287 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDH11P55287 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDH11P55287 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDH11P55287 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDH11P55287 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDH11P55287 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDH11P55287 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDH11P55287 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDH11P55287 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDH11P55287 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDH11P55287 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDH11P55287 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDH11P55287 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDH11P55287 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDH11P55287 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDH11P55287 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDH11P55287 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDH11P55287 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDH11P55287 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH11P55287 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH11P55287 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH11P55287 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH11P55287 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH11P55287 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH11P55287 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH11P55287 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH11P55287 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH11P55287 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH11P55287 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH11P55287 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH11P55287 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH11P55287 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDH11P55287 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDH11P55287 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDH11P55287 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDH11P55287 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDH11P55287 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDH11P55287 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CDH11P55287 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDH11P55287 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH11P55287 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH11P55287 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH11P55287 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH11P55287 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH11P55287 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH11P55287 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH11P55287 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH11P55287 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH11P55287 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH11P55287 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH11P55287 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH11P55287 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH11P55287 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDH11P55287 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDH11P55287 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDH11P55287 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDH11P55287 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDH11P55287 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDH11P55287 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH11P55287 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH11P55287 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH11P55287 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH11P55287 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH11P55287 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH11P55287 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH11P55287 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH11P55287 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH11P55287 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH11P55287 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH11P55287 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH11P55287 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH11P55287 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH11P55287 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms