Protein–RNA interactions for Protein: P55000

SLURP1, Secreted Ly-6/uPAR-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLURP1P55000 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SLURP1P55000 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLURP1P55000 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLURP1P55000 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLURP1P55000 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLURP1P55000 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLURP1P55000 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLURP1P55000 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SLURP1P55000 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLURP1P55000 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLURP1P55000 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SLURP1P55000 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SLURP1P55000 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLURP1P55000 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLURP1P55000 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLURP1P55000 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLURP1P55000 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLURP1P55000 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLURP1P55000 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLURP1P55000 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLURP1P55000 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLURP1P55000 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLURP1P55000 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLURP1P55000 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLURP1P55000 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLURP1P55000 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLURP1P55000 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLURP1P55000 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLURP1P55000 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLURP1P55000 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLURP1P55000 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SLURP1P55000 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLURP1P55000 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLURP1P55000 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLURP1P55000 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLURP1P55000 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLURP1P55000 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLURP1P55000 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLURP1P55000 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLURP1P55000 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLURP1P55000 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLURP1P55000 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLURP1P55000 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLURP1P55000 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLURP1P55000 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLURP1P55000 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLURP1P55000 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLURP1P55000 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLURP1P55000 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLURP1P55000 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLURP1P55000 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLURP1P55000 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLURP1P55000 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLURP1P55000 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLURP1P55000 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLURP1P55000 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLURP1P55000 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLURP1P55000 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLURP1P55000 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLURP1P55000 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SLURP1P55000 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLURP1P55000 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLURP1P55000 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLURP1P55000 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLURP1P55000 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLURP1P55000 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLURP1P55000 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLURP1P55000 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLURP1P55000 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLURP1P55000 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLURP1P55000 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLURP1P55000 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLURP1P55000 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLURP1P55000 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLURP1P55000 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLURP1P55000 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLURP1P55000 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLURP1P55000 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLURP1P55000 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLURP1P55000 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLURP1P55000 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLURP1P55000 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLURP1P55000 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLURP1P55000 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SLURP1P55000 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLURP1P55000 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLURP1P55000 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLURP1P55000 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLURP1P55000 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLURP1P55000 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLURP1P55000 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SLURP1P55000 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SLURP1P55000 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLURP1P55000 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLURP1P55000 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLURP1P55000 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLURP1P55000 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLURP1P55000 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLURP1P55000 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLURP1P55000 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms