Protein–RNA interactions for Protein: P54845

NRL, Neural retina-specific leucine zipper protein, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRLP54845 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NRLP54845 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NRLP54845 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NRLP54845 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NRLP54845 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NRLP54845 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NRLP54845 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NRLP54845 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NRLP54845 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NRLP54845 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NRLP54845 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NRLP54845 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NRLP54845 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NRLP54845 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NRLP54845 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NRLP54845 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NRLP54845 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NRLP54845 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NRLP54845 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NRLP54845 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NRLP54845 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NRLP54845 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NRLP54845 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NRLP54845 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NRLP54845 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NRLP54845 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NRLP54845 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NRLP54845 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NRLP54845 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NRLP54845 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NRLP54845 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NRLP54845 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NRLP54845 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NRLP54845 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NRLP54845 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NRLP54845 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NRLP54845 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NRLP54845 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NRLP54845 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NRLP54845 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NRLP54845 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NRLP54845 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NRLP54845 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NRLP54845 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NRLP54845 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NRLP54845 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NRLP54845 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NRLP54845 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NRLP54845 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NRLP54845 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NRLP54845 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NRLP54845 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NRLP54845 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NRLP54845 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NRLP54845 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NRLP54845 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NRLP54845 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NRLP54845 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NRLP54845 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NRLP54845 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NRLP54845 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NRLP54845 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NRLP54845 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NRLP54845 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NRLP54845 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NRLP54845 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NRLP54845 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NRLP54845 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NRLP54845 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NRLP54845 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NRLP54845 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NRLP54845 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NRLP54845 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NRLP54845 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NRLP54845 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NRLP54845 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NRLP54845 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NRLP54845 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NRLP54845 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NRLP54845 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NRLP54845 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NRLP54845 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NRLP54845 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NRLP54845 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NRLP54845 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NRLP54845 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NRLP54845 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NRLP54845 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NRLP54845 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NRLP54845 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NRLP54845 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NRLP54845 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NRLP54845 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NRLP54845 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NRLP54845 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NRLP54845 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NRLP54845 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NRLP54845 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NRLP54845 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NRLP54845 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms