Protein–RNA interactions for Protein: P54762

EPHB1, Ephrin type-B receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 984 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB1P54762 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EPHB1P54762 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EPHB1P54762 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EPHB1P54762 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EPHB1P54762 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EPHB1P54762 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
EPHB1P54762 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EPHB1P54762 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
EPHB1P54762 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EPHB1P54762 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EPHB1P54762 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EPHB1P54762 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EPHB1P54762 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EPHB1P54762 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EPHB1P54762 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EPHB1P54762 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
EPHB1P54762 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EPHB1P54762 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EPHB1P54762 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EPHB1P54762 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EPHB1P54762 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EPHB1P54762 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EPHB1P54762 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EPHB1P54762 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EPHB1P54762 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EPHB1P54762 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EPHB1P54762 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EPHB1P54762 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EPHB1P54762 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EPHB1P54762 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EPHB1P54762 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EPHB1P54762 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EPHB1P54762 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EPHB1P54762 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
EPHB1P54762 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
EPHB1P54762 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
EPHB1P54762 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
EPHB1P54762 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EPHB1P54762 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EPHB1P54762 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EPHB1P54762 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EPHB1P54762 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EPHB1P54762 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EPHB1P54762 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EPHB1P54762 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EPHB1P54762 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EPHB1P54762 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EPHB1P54762 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EPHB1P54762 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EPHB1P54762 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EPHB1P54762 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EPHB1P54762 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EPHB1P54762 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EPHB1P54762 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EPHB1P54762 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EPHB1P54762 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EPHB1P54762 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
EPHB1P54762 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EPHB1P54762 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EPHB1P54762 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EPHB1P54762 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EPHB1P54762 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EPHB1P54762 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EPHB1P54762 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EPHB1P54762 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EPHB1P54762 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EPHB1P54762 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EPHB1P54762 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EPHB1P54762 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EPHB1P54762 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EPHB1P54762 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EPHB1P54762 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EPHB1P54762 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EPHB1P54762 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EPHB1P54762 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EPHB1P54762 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EPHB1P54762 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EPHB1P54762 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EPHB1P54762 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EPHB1P54762 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EPHB1P54762 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EPHB1P54762 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EPHB1P54762 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EPHB1P54762 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EPHB1P54762 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EPHB1P54762 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
EPHB1P54762 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EPHB1P54762 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
EPHB1P54762 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EPHB1P54762 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EPHB1P54762 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EPHB1P54762 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EPHB1P54762 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EPHB1P54762 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EPHB1P54762 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EPHB1P54762 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EPHB1P54762 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EPHB1P54762 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EPHB1P54762 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EPHB1P54762 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 246.6 ms