Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CACNB3P54284 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CACNB3P54284 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CACNB3P54284 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CACNB3P54284 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CACNB3P54284 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CACNB3P54284 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CACNB3P54284 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CACNB3P54284 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CACNB3P54284 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CACNB3P54284 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CACNB3P54284 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CACNB3P54284 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CACNB3P54284 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CACNB3P54284 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CACNB3P54284 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CACNB3P54284 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CACNB3P54284 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CACNB3P54284 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CACNB3P54284 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CACNB3P54284 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CACNB3P54284 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CACNB3P54284 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CACNB3P54284 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CACNB3P54284 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CACNB3P54284 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CACNB3P54284 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CACNB3P54284 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CACNB3P54284 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CACNB3P54284 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
CACNB3P54284 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CACNB3P54284 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CACNB3P54284 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CACNB3P54284 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CACNB3P54284 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CACNB3P54284 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CACNB3P54284 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CACNB3P54284 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CACNB3P54284 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CACNB3P54284 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CACNB3P54284 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CACNB3P54284 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CACNB3P54284 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CACNB3P54284 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CACNB3P54284 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CACNB3P54284 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CACNB3P54284 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CACNB3P54284 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CACNB3P54284 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CACNB3P54284 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CACNB3P54284 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CACNB3P54284 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CACNB3P54284 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CACNB3P54284 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CACNB3P54284 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CACNB3P54284 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CACNB3P54284 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CACNB3P54284 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CACNB3P54284 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CACNB3P54284 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CACNB3P54284 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CACNB3P54284 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CACNB3P54284 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CACNB3P54284 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CACNB3P54284 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CACNB3P54284 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CACNB3P54284 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CACNB3P54284 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CACNB3P54284 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CACNB3P54284 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CACNB3P54284 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CACNB3P54284 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CACNB3P54284 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CACNB3P54284 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CACNB3P54284 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
CACNB3P54284 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CACNB3P54284 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CACNB3P54284 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CACNB3P54284 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CACNB3P54284 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CACNB3P54284 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CACNB3P54284 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CACNB3P54284 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CACNB3P54284 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CACNB3P54284 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CACNB3P54284 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CACNB3P54284 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CACNB3P54284 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CACNB3P54284 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CACNB3P54284 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CACNB3P54284 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CACNB3P54284 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CACNB3P54284 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CACNB3P54284 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CACNB3P54284 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CACNB3P54284 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CACNB3P54284 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CACNB3P54284 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CACNB3P54284 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CACNB3P54284 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms