Protein–RNA interactions for Protein: P53814

SMTN, Smoothelin, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNP53814 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMTNP53814 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMTNP53814 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMTNP53814 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMTNP53814 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMTNP53814 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMTNP53814 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMTNP53814 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMTNP53814 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMTNP53814 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMTNP53814 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMTNP53814 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SMTNP53814 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMTNP53814 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMTNP53814 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMTNP53814 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMTNP53814 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SMTNP53814 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMTNP53814 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMTNP53814 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMTNP53814 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMTNP53814 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SMTNP53814 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMTNP53814 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMTNP53814 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMTNP53814 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMTNP53814 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMTNP53814 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMTNP53814 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMTNP53814 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMTNP53814 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMTNP53814 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMTNP53814 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMTNP53814 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMTNP53814 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SMTNP53814 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SMTNP53814 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMTNP53814 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMTNP53814 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMTNP53814 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMTNP53814 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMTNP53814 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMTNP53814 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMTNP53814 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMTNP53814 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMTNP53814 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMTNP53814 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SMTNP53814 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMTNP53814 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMTNP53814 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMTNP53814 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMTNP53814 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMTNP53814 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMTNP53814 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMTNP53814 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMTNP53814 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMTNP53814 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMTNP53814 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMTNP53814 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMTNP53814 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMTNP53814 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SMTNP53814 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMTNP53814 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMTNP53814 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMTNP53814 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMTNP53814 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMTNP53814 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SMTNP53814 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMTNP53814 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SMTNP53814 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SMTNP53814 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SMTNP53814 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SMTNP53814 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SMTNP53814 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SMTNP53814 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SMTNP53814 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SMTNP53814 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SMTNP53814 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SMTNP53814 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SMTNP53814 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SMTNP53814 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SMTNP53814 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMTNP53814 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMTNP53814 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMTNP53814 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMTNP53814 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMTNP53814 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMTNP53814 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMTNP53814 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMTNP53814 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SMTNP53814 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMTNP53814 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMTNP53814 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMTNP53814 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMTNP53814 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMTNP53814 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMTNP53814 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SMTNP53814 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMTNP53814 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMTNP53814 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms