Protein–RNA interactions for Protein: P52888

THOP1, Thimet oligopeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THOP1P52888 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
THOP1P52888 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
THOP1P52888 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
THOP1P52888 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
THOP1P52888 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
THOP1P52888 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
THOP1P52888 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
THOP1P52888 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
THOP1P52888 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
THOP1P52888 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
THOP1P52888 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
THOP1P52888 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
THOP1P52888 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
THOP1P52888 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
THOP1P52888 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
THOP1P52888 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
THOP1P52888 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
THOP1P52888 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
THOP1P52888 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
THOP1P52888 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
THOP1P52888 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
THOP1P52888 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
THOP1P52888 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
THOP1P52888 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
THOP1P52888 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
THOP1P52888 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
THOP1P52888 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
THOP1P52888 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
THOP1P52888 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
THOP1P52888 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
THOP1P52888 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
THOP1P52888 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
THOP1P52888 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
THOP1P52888 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
THOP1P52888 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
THOP1P52888 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
THOP1P52888 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
THOP1P52888 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
THOP1P52888 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
THOP1P52888 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
THOP1P52888 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
THOP1P52888 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
THOP1P52888 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
THOP1P52888 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
THOP1P52888 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
THOP1P52888 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
THOP1P52888 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
THOP1P52888 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
THOP1P52888 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
THOP1P52888 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
THOP1P52888 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
THOP1P52888 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
THOP1P52888 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
THOP1P52888 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
THOP1P52888 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
THOP1P52888 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
THOP1P52888 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
THOP1P52888 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
THOP1P52888 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
THOP1P52888 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
THOP1P52888 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
THOP1P52888 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
THOP1P52888 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
THOP1P52888 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
THOP1P52888 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
THOP1P52888 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
THOP1P52888 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
THOP1P52888 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
THOP1P52888 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
THOP1P52888 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
THOP1P52888 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
THOP1P52888 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
THOP1P52888 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
THOP1P52888 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
THOP1P52888 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
THOP1P52888 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
THOP1P52888 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
THOP1P52888 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
THOP1P52888 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
THOP1P52888 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
THOP1P52888 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
THOP1P52888 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
THOP1P52888 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
THOP1P52888 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
THOP1P52888 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
THOP1P52888 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
THOP1P52888 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
THOP1P52888 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
THOP1P52888 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
THOP1P52888 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
THOP1P52888 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
THOP1P52888 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
THOP1P52888 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
THOP1P52888 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
THOP1P52888 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
THOP1P52888 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
THOP1P52888 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
THOP1P52888 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
THOP1P52888 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
THOP1P52888 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms