Protein–RNA interactions for Protein: P51956

NEK3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK3P51956 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEK3P51956 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEK3P51956 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEK3P51956 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEK3P51956 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEK3P51956 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NEK3P51956 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEK3P51956 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEK3P51956 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEK3P51956 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEK3P51956 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NEK3P51956 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NEK3P51956 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEK3P51956 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEK3P51956 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEK3P51956 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEK3P51956 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEK3P51956 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEK3P51956 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEK3P51956 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEK3P51956 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEK3P51956 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEK3P51956 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEK3P51956 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEK3P51956 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEK3P51956 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEK3P51956 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEK3P51956 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NEK3P51956 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEK3P51956 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEK3P51956 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEK3P51956 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NEK3P51956 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NEK3P51956 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEK3P51956 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NEK3P51956 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEK3P51956 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NEK3P51956 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEK3P51956 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEK3P51956 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEK3P51956 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEK3P51956 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEK3P51956 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEK3P51956 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEK3P51956 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEK3P51956 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEK3P51956 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEK3P51956 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NEK3P51956 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEK3P51956 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEK3P51956 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEK3P51956 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEK3P51956 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEK3P51956 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEK3P51956 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEK3P51956 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEK3P51956 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEK3P51956 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEK3P51956 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEK3P51956 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEK3P51956 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEK3P51956 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NEK3P51956 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEK3P51956 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEK3P51956 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEK3P51956 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEK3P51956 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEK3P51956 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEK3P51956 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEK3P51956 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEK3P51956 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEK3P51956 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEK3P51956 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEK3P51956 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NEK3P51956 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEK3P51956 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEK3P51956 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEK3P51956 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEK3P51956 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEK3P51956 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEK3P51956 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEK3P51956 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEK3P51956 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEK3P51956 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEK3P51956 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
NEK3P51956 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NEK3P51956 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NEK3P51956 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NEK3P51956 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEK3P51956 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEK3P51956 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NEK3P51956 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NEK3P51956 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEK3P51956 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEK3P51956 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEK3P51956 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEK3P51956 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEK3P51956 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NEK3P51956 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEK3P51956 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms