Protein–RNA interactions for Protein: P51805

PLXNA3, Plexin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 1,871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA3P51805 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PLXNA3P51805 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PLXNA3P51805 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PLXNA3P51805 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PLXNA3P51805 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PLXNA3P51805 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PLXNA3P51805 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PLXNA3P51805 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PLXNA3P51805 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PLXNA3P51805 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PLXNA3P51805 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PLXNA3P51805 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PLXNA3P51805 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PLXNA3P51805 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PLXNA3P51805 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PLXNA3P51805 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PLXNA3P51805 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PLXNA3P51805 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PLXNA3P51805 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PLXNA3P51805 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PLXNA3P51805 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PLXNA3P51805 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PLXNA3P51805 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PLXNA3P51805 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PLXNA3P51805 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PLXNA3P51805 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PLXNA3P51805 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PLXNA3P51805 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PLXNA3P51805 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PLXNA3P51805 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PLXNA3P51805 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PLXNA3P51805 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PLXNA3P51805 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PLXNA3P51805 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PLXNA3P51805 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PLXNA3P51805 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PLXNA3P51805 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PLXNA3P51805 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PLXNA3P51805 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PLXNA3P51805 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PLXNA3P51805 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PLXNA3P51805 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PLXNA3P51805 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PLXNA3P51805 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PLXNA3P51805 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PLXNA3P51805 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PLXNA3P51805 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PLXNA3P51805 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PLXNA3P51805 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PLXNA3P51805 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PLXNA3P51805 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PLXNA3P51805 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PLXNA3P51805 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PLXNA3P51805 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PLXNA3P51805 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PLXNA3P51805 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PLXNA3P51805 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PLXNA3P51805 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PLXNA3P51805 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PLXNA3P51805 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PLXNA3P51805 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PLXNA3P51805 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PLXNA3P51805 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PLXNA3P51805 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PLXNA3P51805 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PLXNA3P51805 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PLXNA3P51805 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PLXNA3P51805 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PLXNA3P51805 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PLXNA3P51805 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PLXNA3P51805 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PLXNA3P51805 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PLXNA3P51805 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PLXNA3P51805 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PLXNA3P51805 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PLXNA3P51805 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PLXNA3P51805 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PLXNA3P51805 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PLXNA3P51805 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PLXNA3P51805 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PLXNA3P51805 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PLXNA3P51805 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PLXNA3P51805 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PLXNA3P51805 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PLXNA3P51805 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PLXNA3P51805 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PLXNA3P51805 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PLXNA3P51805 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PLXNA3P51805 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PLXNA3P51805 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PLXNA3P51805 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PLXNA3P51805 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PLXNA3P51805 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PLXNA3P51805 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PLXNA3P51805 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PLXNA3P51805 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PLXNA3P51805 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PLXNA3P51805 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PLXNA3P51805 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PLXNA3P51805 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms