Protein–RNA interactions for Protein: P51513

NOVA1, RNA-binding protein Nova-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOVA1P51513 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NOVA1P51513 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NOVA1P51513 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NOVA1P51513 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NOVA1P51513 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NOVA1P51513 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NOVA1P51513 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NOVA1P51513 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NOVA1P51513 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NOVA1P51513 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NOVA1P51513 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NOVA1P51513 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NOVA1P51513 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NOVA1P51513 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NOVA1P51513 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NOVA1P51513 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NOVA1P51513 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NOVA1P51513 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NOVA1P51513 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NOVA1P51513 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NOVA1P51513 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NOVA1P51513 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NOVA1P51513 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NOVA1P51513 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NOVA1P51513 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NOVA1P51513 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NOVA1P51513 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NOVA1P51513 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NOVA1P51513 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NOVA1P51513 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NOVA1P51513 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NOVA1P51513 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NOVA1P51513 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NOVA1P51513 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NOVA1P51513 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NOVA1P51513 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NOVA1P51513 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NOVA1P51513 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NOVA1P51513 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NOVA1P51513 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NOVA1P51513 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NOVA1P51513 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NOVA1P51513 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NOVA1P51513 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NOVA1P51513 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NOVA1P51513 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NOVA1P51513 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NOVA1P51513 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NOVA1P51513 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NOVA1P51513 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NOVA1P51513 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NOVA1P51513 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NOVA1P51513 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NOVA1P51513 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NOVA1P51513 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NOVA1P51513 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NOVA1P51513 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NOVA1P51513 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NOVA1P51513 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NOVA1P51513 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NOVA1P51513 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NOVA1P51513 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NOVA1P51513 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NOVA1P51513 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NOVA1P51513 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NOVA1P51513 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NOVA1P51513 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NOVA1P51513 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NOVA1P51513 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NOVA1P51513 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NOVA1P51513 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NOVA1P51513 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NOVA1P51513 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NOVA1P51513 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NOVA1P51513 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NOVA1P51513 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NOVA1P51513 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NOVA1P51513 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NOVA1P51513 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NOVA1P51513 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NOVA1P51513 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NOVA1P51513 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NOVA1P51513 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NOVA1P51513 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NOVA1P51513 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NOVA1P51513 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NOVA1P51513 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NOVA1P51513 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NOVA1P51513 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NOVA1P51513 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NOVA1P51513 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NOVA1P51513 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NOVA1P51513 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NOVA1P51513 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NOVA1P51513 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NOVA1P51513 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NOVA1P51513 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NOVA1P51513 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NOVA1P51513 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NOVA1P51513 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms