Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DAP3P51398 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DAP3P51398 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
DAP3P51398 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DAP3P51398 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DAP3P51398 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DAP3P51398 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DAP3P51398 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DAP3P51398 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DAP3P51398 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DAP3P51398 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DAP3P51398 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DAP3P51398 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DAP3P51398 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DAP3P51398 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DAP3P51398 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DAP3P51398 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DAP3P51398 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DAP3P51398 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
DAP3P51398 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DAP3P51398 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DAP3P51398 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
DAP3P51398 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DAP3P51398 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DAP3P51398 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DAP3P51398 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DAP3P51398 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
DAP3P51398 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DAP3P51398 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DAP3P51398 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DAP3P51398 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
DAP3P51398 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DAP3P51398 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
DAP3P51398 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DAP3P51398 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DAP3P51398 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DAP3P51398 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DAP3P51398 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DAP3P51398 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DAP3P51398 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DAP3P51398 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DAP3P51398 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DAP3P51398 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DAP3P51398 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DAP3P51398 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DAP3P51398 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DAP3P51398 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
DAP3P51398 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DAP3P51398 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DAP3P51398 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DAP3P51398 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DAP3P51398 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
DAP3P51398 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
DAP3P51398 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DAP3P51398 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
DAP3P51398 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DAP3P51398 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DAP3P51398 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DAP3P51398 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DAP3P51398 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DAP3P51398 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DAP3P51398 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DAP3P51398 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DAP3P51398 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DAP3P51398 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DAP3P51398 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
DAP3P51398 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DAP3P51398 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
DAP3P51398 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21■□□□□ 0.95
DAP3P51398 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DAP3P51398 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DAP3P51398 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DAP3P51398 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DAP3P51398 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DAP3P51398 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DAP3P51398 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DAP3P51398 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DAP3P51398 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DAP3P51398 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DAP3P51398 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DAP3P51398 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DAP3P51398 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DAP3P51398 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DAP3P51398 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DAP3P51398 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DAP3P51398 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
DAP3P51398 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DAP3P51398 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DAP3P51398 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DAP3P51398 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DAP3P51398 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
DAP3P51398 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DAP3P51398 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DAP3P51398 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DAP3P51398 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DAP3P51398 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DAP3P51398 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DAP3P51398 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DAP3P51398 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DAP3P51398 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms