Protein–RNA interactions for Protein: P50549

ETV1, ETS translocation variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV1P50549 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ETV1P50549 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ETV1P50549 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ETV1P50549 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ETV1P50549 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ETV1P50549 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ETV1P50549 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ETV1P50549 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ETV1P50549 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ETV1P50549 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ETV1P50549 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ETV1P50549 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ETV1P50549 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ETV1P50549 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ETV1P50549 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ETV1P50549 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ETV1P50549 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ETV1P50549 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ETV1P50549 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ETV1P50549 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ETV1P50549 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ETV1P50549 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ETV1P50549 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ETV1P50549 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ETV1P50549 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ETV1P50549 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ETV1P50549 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ETV1P50549 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ETV1P50549 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ETV1P50549 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ETV1P50549 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ETV1P50549 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ETV1P50549 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ETV1P50549 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ETV1P50549 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ETV1P50549 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ETV1P50549 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ETV1P50549 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ETV1P50549 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ETV1P50549 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ETV1P50549 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ETV1P50549 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ETV1P50549 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ETV1P50549 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ETV1P50549 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ETV1P50549 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ETV1P50549 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ETV1P50549 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ETV1P50549 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ETV1P50549 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ETV1P50549 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ETV1P50549 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ETV1P50549 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ETV1P50549 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ETV1P50549 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ETV1P50549 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ETV1P50549 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ETV1P50549 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ETV1P50549 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ETV1P50549 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ETV1P50549 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ETV1P50549 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ETV1P50549 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
ETV1P50549 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ETV1P50549 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ETV1P50549 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ETV1P50549 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ETV1P50549 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ETV1P50549 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ETV1P50549 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ETV1P50549 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ETV1P50549 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ETV1P50549 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ETV1P50549 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ETV1P50549 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ETV1P50549 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ETV1P50549 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ETV1P50549 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ETV1P50549 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ETV1P50549 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ETV1P50549 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ETV1P50549 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ETV1P50549 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ETV1P50549 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ETV1P50549 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ETV1P50549 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ETV1P50549 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ETV1P50549 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ETV1P50549 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ETV1P50549 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ETV1P50549 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ETV1P50549 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ETV1P50549 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ETV1P50549 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
ETV1P50549 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
ETV1P50549 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
ETV1P50549 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ETV1P50549 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ETV1P50549 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ETV1P50549 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms