Protein–RNA interactions for Protein: P50406

HTR6, 5-hydroxytryptamine receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR6P50406 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HTR6P50406 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HTR6P50406 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HTR6P50406 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HTR6P50406 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HTR6P50406 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HTR6P50406 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HTR6P50406 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HTR6P50406 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HTR6P50406 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HTR6P50406 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HTR6P50406 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HTR6P50406 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HTR6P50406 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HTR6P50406 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HTR6P50406 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HTR6P50406 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HTR6P50406 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HTR6P50406 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HTR6P50406 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HTR6P50406 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HTR6P50406 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HTR6P50406 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HTR6P50406 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HTR6P50406 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HTR6P50406 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HTR6P50406 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HTR6P50406 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HTR6P50406 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HTR6P50406 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HTR6P50406 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HTR6P50406 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HTR6P50406 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HTR6P50406 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HTR6P50406 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HTR6P50406 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HTR6P50406 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HTR6P50406 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HTR6P50406 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HTR6P50406 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HTR6P50406 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HTR6P50406 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HTR6P50406 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HTR6P50406 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HTR6P50406 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HTR6P50406 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HTR6P50406 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HTR6P50406 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HTR6P50406 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HTR6P50406 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HTR6P50406 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HTR6P50406 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HTR6P50406 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HTR6P50406 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HTR6P50406 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HTR6P50406 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HTR6P50406 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HTR6P50406 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HTR6P50406 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HTR6P50406 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HTR6P50406 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HTR6P50406 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HTR6P50406 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HTR6P50406 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HTR6P50406 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HTR6P50406 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HTR6P50406 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HTR6P50406 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HTR6P50406 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HTR6P50406 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HTR6P50406 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HTR6P50406 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HTR6P50406 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HTR6P50406 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HTR6P50406 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HTR6P50406 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HTR6P50406 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HTR6P50406 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HTR6P50406 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HTR6P50406 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HTR6P50406 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HTR6P50406 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HTR6P50406 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HTR6P50406 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HTR6P50406 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HTR6P50406 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HTR6P50406 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HTR6P50406 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HTR6P50406 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HTR6P50406 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HTR6P50406 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HTR6P50406 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HTR6P50406 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HTR6P50406 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HTR6P50406 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HTR6P50406 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HTR6P50406 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HTR6P50406 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HTR6P50406 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HTR6P50406 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms