Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CASP4P49662 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CASP4P49662 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CASP4P49662 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CASP4P49662 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CASP4P49662 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CASP4P49662 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CASP4P49662 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CASP4P49662 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CASP4P49662 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CASP4P49662 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CASP4P49662 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CASP4P49662 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CASP4P49662 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CASP4P49662 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CASP4P49662 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CASP4P49662 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CASP4P49662 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CASP4P49662 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CASP4P49662 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CASP4P49662 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CASP4P49662 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CASP4P49662 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CASP4P49662 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CASP4P49662 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CASP4P49662 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CASP4P49662 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CASP4P49662 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CASP4P49662 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CASP4P49662 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CASP4P49662 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CASP4P49662 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CASP4P49662 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CASP4P49662 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CASP4P49662 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CASP4P49662 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CASP4P49662 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CASP4P49662 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CASP4P49662 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CASP4P49662 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CASP4P49662 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CASP4P49662 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CASP4P49662 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CASP4P49662 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CASP4P49662 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CASP4P49662 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CASP4P49662 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CASP4P49662 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CASP4P49662 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CASP4P49662 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CASP4P49662 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CASP4P49662 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CASP4P49662 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CASP4P49662 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CASP4P49662 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CASP4P49662 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CASP4P49662 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CASP4P49662 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CASP4P49662 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CASP4P49662 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CASP4P49662 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CASP4P49662 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CASP4P49662 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CASP4P49662 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CASP4P49662 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CASP4P49662 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CASP4P49662 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CASP4P49662 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CASP4P49662 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CASP4P49662 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CASP4P49662 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CASP4P49662 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CASP4P49662 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CASP4P49662 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CASP4P49662 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CASP4P49662 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CASP4P49662 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CASP4P49662 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
CASP4P49662 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CASP4P49662 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CASP4P49662 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CASP4P49662 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CASP4P49662 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CASP4P49662 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CASP4P49662 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CASP4P49662 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CASP4P49662 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CASP4P49662 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CASP4P49662 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CASP4P49662 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CASP4P49662 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CASP4P49662 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CASP4P49662 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CASP4P49662 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CASP4P49662 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CASP4P49662 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CASP4P49662 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CASP4P49662 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CASP4P49662 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CASP4P49662 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms