Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRPC1P48995 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRPC1P48995 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRPC1P48995 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRPC1P48995 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRPC1P48995 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRPC1P48995 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRPC1P48995 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRPC1P48995 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRPC1P48995 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRPC1P48995 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TRPC1P48995 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRPC1P48995 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRPC1P48995 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRPC1P48995 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRPC1P48995 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRPC1P48995 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRPC1P48995 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRPC1P48995 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRPC1P48995 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRPC1P48995 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRPC1P48995 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRPC1P48995 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TRPC1P48995 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRPC1P48995 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRPC1P48995 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRPC1P48995 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRPC1P48995 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRPC1P48995 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRPC1P48995 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRPC1P48995 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRPC1P48995 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRPC1P48995 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRPC1P48995 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRPC1P48995 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRPC1P48995 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRPC1P48995 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRPC1P48995 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRPC1P48995 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRPC1P48995 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TRPC1P48995 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRPC1P48995 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRPC1P48995 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRPC1P48995 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRPC1P48995 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TRPC1P48995 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRPC1P48995 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRPC1P48995 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRPC1P48995 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRPC1P48995 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRPC1P48995 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRPC1P48995 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRPC1P48995 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRPC1P48995 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TRPC1P48995 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRPC1P48995 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRPC1P48995 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRPC1P48995 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TRPC1P48995 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRPC1P48995 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRPC1P48995 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRPC1P48995 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRPC1P48995 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TRPC1P48995 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRPC1P48995 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRPC1P48995 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRPC1P48995 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRPC1P48995 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRPC1P48995 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRPC1P48995 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRPC1P48995 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRPC1P48995 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRPC1P48995 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRPC1P48995 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRPC1P48995 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRPC1P48995 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRPC1P48995 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRPC1P48995 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TRPC1P48995 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRPC1P48995 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRPC1P48995 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRPC1P48995 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRPC1P48995 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRPC1P48995 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRPC1P48995 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRPC1P48995 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRPC1P48995 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRPC1P48995 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRPC1P48995 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRPC1P48995 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TRPC1P48995 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRPC1P48995 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRPC1P48995 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRPC1P48995 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRPC1P48995 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRPC1P48995 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRPC1P48995 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRPC1P48995 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TRPC1P48995 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRPC1P48995 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms