Protein–RNA interactions for Protein: P48742

LHX1, LIM/homeobox protein Lhx1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1P48742 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LHX1P48742 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LHX1P48742 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LHX1P48742 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LHX1P48742 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LHX1P48742 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LHX1P48742 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LHX1P48742 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LHX1P48742 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LHX1P48742 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LHX1P48742 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
LHX1P48742 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LHX1P48742 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LHX1P48742 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LHX1P48742 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LHX1P48742 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LHX1P48742 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LHX1P48742 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LHX1P48742 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LHX1P48742 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LHX1P48742 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LHX1P48742 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LHX1P48742 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LHX1P48742 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LHX1P48742 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LHX1P48742 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LHX1P48742 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LHX1P48742 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LHX1P48742 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LHX1P48742 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LHX1P48742 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LHX1P48742 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LHX1P48742 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LHX1P48742 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LHX1P48742 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LHX1P48742 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LHX1P48742 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LHX1P48742 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LHX1P48742 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LHX1P48742 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LHX1P48742 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LHX1P48742 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LHX1P48742 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LHX1P48742 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LHX1P48742 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LHX1P48742 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
LHX1P48742 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LHX1P48742 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LHX1P48742 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LHX1P48742 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LHX1P48742 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LHX1P48742 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LHX1P48742 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LHX1P48742 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LHX1P48742 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LHX1P48742 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LHX1P48742 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LHX1P48742 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LHX1P48742 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LHX1P48742 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LHX1P48742 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LHX1P48742 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
LHX1P48742 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LHX1P48742 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LHX1P48742 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LHX1P48742 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LHX1P48742 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LHX1P48742 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LHX1P48742 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
LHX1P48742 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
LHX1P48742 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LHX1P48742 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LHX1P48742 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LHX1P48742 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LHX1P48742 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LHX1P48742 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
LHX1P48742 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
LHX1P48742 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LHX1P48742 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LHX1P48742 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LHX1P48742 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LHX1P48742 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LHX1P48742 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LHX1P48742 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LHX1P48742 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LHX1P48742 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LHX1P48742 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LHX1P48742 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
LHX1P48742 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LHX1P48742 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LHX1P48742 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LHX1P48742 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
LHX1P48742 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LHX1P48742 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LHX1P48742 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LHX1P48742 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LHX1P48742 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LHX1P48742 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LHX1P48742 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LHX1P48742 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms