Protein–RNA interactions for Protein: P48668

KRT6C, Keratin, type II cytoskeletal 6C, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6CP48668 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT6CP48668 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT6CP48668 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT6CP48668 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT6CP48668 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT6CP48668 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT6CP48668 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT6CP48668 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT6CP48668 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT6CP48668 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT6CP48668 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT6CP48668 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT6CP48668 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT6CP48668 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT6CP48668 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT6CP48668 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT6CP48668 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT6CP48668 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT6CP48668 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT6CP48668 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT6CP48668 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT6CP48668 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT6CP48668 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT6CP48668 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT6CP48668 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT6CP48668 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT6CP48668 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT6CP48668 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT6CP48668 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT6CP48668 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT6CP48668 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT6CP48668 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT6CP48668 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT6CP48668 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT6CP48668 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT6CP48668 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT6CP48668 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT6CP48668 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT6CP48668 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT6CP48668 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT6CP48668 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT6CP48668 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT6CP48668 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT6CP48668 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT6CP48668 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT6CP48668 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT6CP48668 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT6CP48668 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT6CP48668 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT6CP48668 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT6CP48668 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT6CP48668 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT6CP48668 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT6CP48668 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT6CP48668 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT6CP48668 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT6CP48668 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT6CP48668 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT6CP48668 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT6CP48668 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT6CP48668 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT6CP48668 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT6CP48668 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT6CP48668 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT6CP48668 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT6CP48668 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT6CP48668 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT6CP48668 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT6CP48668 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT6CP48668 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
KRT6CP48668 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
KRT6CP48668 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT6CP48668 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT6CP48668 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT6CP48668 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT6CP48668 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT6CP48668 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT6CP48668 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT6CP48668 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT6CP48668 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT6CP48668 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT6CP48668 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT6CP48668 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT6CP48668 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT6CP48668 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT6CP48668 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT6CP48668 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT6CP48668 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT6CP48668 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT6CP48668 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT6CP48668 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT6CP48668 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT6CP48668 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT6CP48668 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT6CP48668 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT6CP48668 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT6CP48668 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT6CP48668 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT6CP48668 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT6CP48668 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms