Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATRXP46100 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATRXP46100 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATRXP46100 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATRXP46100 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATRXP46100 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATRXP46100 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATRXP46100 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATRXP46100 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATRXP46100 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATRXP46100 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATRXP46100 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATRXP46100 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATRXP46100 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATRXP46100 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATRXP46100 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATRXP46100 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATRXP46100 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
ATRXP46100 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATRXP46100 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATRXP46100 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATRXP46100 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATRXP46100 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATRXP46100 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATRXP46100 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATRXP46100 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATRXP46100 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ATRXP46100 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATRXP46100 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATRXP46100 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATRXP46100 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATRXP46100 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATRXP46100 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATRXP46100 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATRXP46100 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATRXP46100 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATRXP46100 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATRXP46100 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATRXP46100 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATRXP46100 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATRXP46100 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATRXP46100 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATRXP46100 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATRXP46100 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATRXP46100 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATRXP46100 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATRXP46100 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATRXP46100 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATRXP46100 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATRXP46100 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATRXP46100 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATRXP46100 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATRXP46100 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATRXP46100 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATRXP46100 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATRXP46100 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATRXP46100 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ATRXP46100 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATRXP46100 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATRXP46100 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATRXP46100 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATRXP46100 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATRXP46100 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATRXP46100 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATRXP46100 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATRXP46100 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATRXP46100 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATRXP46100 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATRXP46100 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATRXP46100 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATRXP46100 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATRXP46100 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATRXP46100 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATRXP46100 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATRXP46100 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATRXP46100 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATRXP46100 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATRXP46100 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATRXP46100 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATRXP46100 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATRXP46100 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ATRXP46100 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATRXP46100 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ATRXP46100 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATRXP46100 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATRXP46100 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATRXP46100 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATRXP46100 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATRXP46100 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATRXP46100 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATRXP46100 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATRXP46100 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATRXP46100 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATRXP46100 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATRXP46100 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATRXP46100 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATRXP46100 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATRXP46100 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATRXP46100 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATRXP46100 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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