Protein–RNA interactions for Protein: P42356

PI4KA, Phosphatidylinositol 4-kinase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 2,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PI4KAP42356 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PI4KAP42356 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PI4KAP42356 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PI4KAP42356 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PI4KAP42356 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PI4KAP42356 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PI4KAP42356 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PI4KAP42356 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PI4KAP42356 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PI4KAP42356 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PI4KAP42356 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PI4KAP42356 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PI4KAP42356 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PI4KAP42356 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PI4KAP42356 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PI4KAP42356 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PI4KAP42356 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PI4KAP42356 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PI4KAP42356 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PI4KAP42356 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PI4KAP42356 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PI4KAP42356 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PI4KAP42356 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PI4KAP42356 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PI4KAP42356 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PI4KAP42356 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PI4KAP42356 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PI4KAP42356 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PI4KAP42356 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PI4KAP42356 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PI4KAP42356 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PI4KAP42356 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PI4KAP42356 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PI4KAP42356 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PI4KAP42356 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PI4KAP42356 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PI4KAP42356 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PI4KAP42356 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PI4KAP42356 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PI4KAP42356 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PI4KAP42356 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PI4KAP42356 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PI4KAP42356 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PI4KAP42356 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PI4KAP42356 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PI4KAP42356 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PI4KAP42356 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PI4KAP42356 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PI4KAP42356 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PI4KAP42356 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PI4KAP42356 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PI4KAP42356 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PI4KAP42356 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PI4KAP42356 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PI4KAP42356 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PI4KAP42356 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PI4KAP42356 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PI4KAP42356 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PI4KAP42356 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PI4KAP42356 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PI4KAP42356 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PI4KAP42356 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PI4KAP42356 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PI4KAP42356 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PI4KAP42356 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PI4KAP42356 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PI4KAP42356 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PI4KAP42356 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PI4KAP42356 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PI4KAP42356 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PI4KAP42356 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PI4KAP42356 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PI4KAP42356 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PI4KAP42356 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PI4KAP42356 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PI4KAP42356 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PI4KAP42356 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PI4KAP42356 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PI4KAP42356 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PI4KAP42356 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PI4KAP42356 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PI4KAP42356 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PI4KAP42356 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PI4KAP42356 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PI4KAP42356 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PI4KAP42356 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PI4KAP42356 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PI4KAP42356 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PI4KAP42356 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PI4KAP42356 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PI4KAP42356 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PI4KAP42356 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PI4KAP42356 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PI4KAP42356 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PI4KAP42356 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PI4KAP42356 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PI4KAP42356 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PI4KAP42356 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PI4KAP42356 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PI4KAP42356 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms