Protein–RNA interactions for Protein: P41222

PTGDS, Prostaglandin-H2 D-isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDSP41222 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTGDSP41222 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTGDSP41222 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTGDSP41222 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTGDSP41222 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTGDSP41222 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTGDSP41222 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTGDSP41222 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTGDSP41222 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTGDSP41222 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTGDSP41222 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PTGDSP41222 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTGDSP41222 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PTGDSP41222 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTGDSP41222 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTGDSP41222 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTGDSP41222 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTGDSP41222 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTGDSP41222 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTGDSP41222 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTGDSP41222 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTGDSP41222 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTGDSP41222 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTGDSP41222 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTGDSP41222 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTGDSP41222 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTGDSP41222 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTGDSP41222 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTGDSP41222 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTGDSP41222 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTGDSP41222 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTGDSP41222 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTGDSP41222 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTGDSP41222 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTGDSP41222 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTGDSP41222 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTGDSP41222 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTGDSP41222 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PTGDSP41222 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTGDSP41222 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTGDSP41222 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTGDSP41222 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTGDSP41222 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTGDSP41222 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTGDSP41222 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTGDSP41222 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTGDSP41222 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTGDSP41222 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTGDSP41222 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTGDSP41222 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PTGDSP41222 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PTGDSP41222 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PTGDSP41222 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTGDSP41222 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTGDSP41222 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PTGDSP41222 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTGDSP41222 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PTGDSP41222 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PTGDSP41222 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTGDSP41222 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTGDSP41222 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTGDSP41222 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTGDSP41222 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTGDSP41222 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTGDSP41222 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTGDSP41222 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTGDSP41222 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTGDSP41222 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTGDSP41222 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTGDSP41222 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTGDSP41222 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTGDSP41222 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTGDSP41222 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTGDSP41222 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTGDSP41222 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTGDSP41222 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTGDSP41222 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTGDSP41222 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTGDSP41222 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTGDSP41222 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTGDSP41222 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTGDSP41222 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTGDSP41222 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTGDSP41222 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTGDSP41222 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTGDSP41222 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTGDSP41222 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTGDSP41222 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTGDSP41222 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTGDSP41222 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTGDSP41222 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PTGDSP41222 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTGDSP41222 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTGDSP41222 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTGDSP41222 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTGDSP41222 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PTGDSP41222 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTGDSP41222 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTGDSP41222 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTGDSP41222 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms