Protein–RNA interactions for Protein: P40429

RPL13A, 60S ribosomal protein L13a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL13AP40429 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPL13AP40429 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPL13AP40429 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPL13AP40429 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPL13AP40429 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPL13AP40429 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPL13AP40429 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPL13AP40429 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPL13AP40429 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPL13AP40429 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPL13AP40429 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPL13AP40429 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPL13AP40429 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPL13AP40429 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPL13AP40429 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPL13AP40429 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPL13AP40429 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPL13AP40429 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPL13AP40429 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPL13AP40429 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPL13AP40429 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPL13AP40429 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPL13AP40429 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPL13AP40429 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RPL13AP40429 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPL13AP40429 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPL13AP40429 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPL13AP40429 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPL13AP40429 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPL13AP40429 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPL13AP40429 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPL13AP40429 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPL13AP40429 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPL13AP40429 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPL13AP40429 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPL13AP40429 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPL13AP40429 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPL13AP40429 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPL13AP40429 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPL13AP40429 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPL13AP40429 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPL13AP40429 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPL13AP40429 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RPL13AP40429 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL13AP40429 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL13AP40429 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL13AP40429 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL13AP40429 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL13AP40429 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL13AP40429 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL13AP40429 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL13AP40429 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL13AP40429 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL13AP40429 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL13AP40429 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL13AP40429 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL13AP40429 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL13AP40429 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL13AP40429 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL13AP40429 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL13AP40429 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL13AP40429 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL13AP40429 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL13AP40429 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL13AP40429 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL13AP40429 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL13AP40429 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL13AP40429 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL13AP40429 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL13AP40429 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL13AP40429 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL13AP40429 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL13AP40429 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL13AP40429 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL13AP40429 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL13AP40429 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL13AP40429 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL13AP40429 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL13AP40429 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL13AP40429 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL13AP40429 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL13AP40429 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL13AP40429 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL13AP40429 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL13AP40429 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL13AP40429 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL13AP40429 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL13AP40429 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL13AP40429 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL13AP40429 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL13AP40429 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL13AP40429 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL13AP40429 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL13AP40429 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL13AP40429 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL13AP40429 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL13AP40429 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL13AP40429 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL13AP40429 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL13AP40429 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms