Protein–RNA interactions for Protein: P40424

PBX1, Pre-B-cell leukemia transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX1P40424 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PBX1P40424 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PBX1P40424 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PBX1P40424 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PBX1P40424 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PBX1P40424 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PBX1P40424 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PBX1P40424 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PBX1P40424 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PBX1P40424 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PBX1P40424 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PBX1P40424 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PBX1P40424 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PBX1P40424 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PBX1P40424 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PBX1P40424 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PBX1P40424 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PBX1P40424 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PBX1P40424 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PBX1P40424 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PBX1P40424 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PBX1P40424 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PBX1P40424 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PBX1P40424 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PBX1P40424 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PBX1P40424 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PBX1P40424 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PBX1P40424 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PBX1P40424 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PBX1P40424 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PBX1P40424 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PBX1P40424 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PBX1P40424 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PBX1P40424 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PBX1P40424 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PBX1P40424 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PBX1P40424 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PBX1P40424 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PBX1P40424 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PBX1P40424 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PBX1P40424 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PBX1P40424 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PBX1P40424 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PBX1P40424 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PBX1P40424 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PBX1P40424 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PBX1P40424 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PBX1P40424 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PBX1P40424 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PBX1P40424 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PBX1P40424 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PBX1P40424 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PBX1P40424 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PBX1P40424 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PBX1P40424 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PBX1P40424 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PBX1P40424 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PBX1P40424 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PBX1P40424 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PBX1P40424 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PBX1P40424 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PBX1P40424 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PBX1P40424 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PBX1P40424 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PBX1P40424 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PBX1P40424 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PBX1P40424 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PBX1P40424 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PBX1P40424 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PBX1P40424 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PBX1P40424 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PBX1P40424 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PBX1P40424 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PBX1P40424 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PBX1P40424 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PBX1P40424 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PBX1P40424 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PBX1P40424 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PBX1P40424 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PBX1P40424 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PBX1P40424 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PBX1P40424 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PBX1P40424 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PBX1P40424 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PBX1P40424 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PBX1P40424 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PBX1P40424 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PBX1P40424 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PBX1P40424 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PBX1P40424 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PBX1P40424 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PBX1P40424 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PBX1P40424 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PBX1P40424 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PBX1P40424 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PBX1P40424 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PBX1P40424 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PBX1P40424 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PBX1P40424 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PBX1P40424 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms