Protein–RNA interactions for Protein: P39023

RPL3, 60S ribosomal protein L3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL3P39023 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPL3P39023 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPL3P39023 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPL3P39023 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPL3P39023 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPL3P39023 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPL3P39023 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPL3P39023 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPL3P39023 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPL3P39023 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPL3P39023 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPL3P39023 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPL3P39023 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPL3P39023 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPL3P39023 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPL3P39023 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPL3P39023 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPL3P39023 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPL3P39023 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RPL3P39023 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPL3P39023 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RPL3P39023 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPL3P39023 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPL3P39023 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPL3P39023 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPL3P39023 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPL3P39023 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPL3P39023 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPL3P39023 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPL3P39023 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPL3P39023 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RPL3P39023 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPL3P39023 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPL3P39023 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPL3P39023 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RPL3P39023 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPL3P39023 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPL3P39023 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPL3P39023 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RPL3P39023 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPL3P39023 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RPL3P39023 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPL3P39023 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPL3P39023 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPL3P39023 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPL3P39023 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPL3P39023 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPL3P39023 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPL3P39023 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPL3P39023 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPL3P39023 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RPL3P39023 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPL3P39023 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPL3P39023 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RPL3P39023 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPL3P39023 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPL3P39023 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPL3P39023 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPL3P39023 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPL3P39023 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPL3P39023 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RPL3P39023 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPL3P39023 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPL3P39023 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL3P39023 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL3P39023 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL3P39023 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL3P39023 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL3P39023 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL3P39023 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL3P39023 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL3P39023 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPL3P39023 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPL3P39023 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPL3P39023 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPL3P39023 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPL3P39023 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPL3P39023 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPL3P39023 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPL3P39023 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPL3P39023 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPL3P39023 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPL3P39023 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPL3P39023 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL3P39023 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL3P39023 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL3P39023 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL3P39023 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL3P39023 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL3P39023 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL3P39023 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL3P39023 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL3P39023 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL3P39023 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL3P39023 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL3P39023 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL3P39023 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPL3P39023 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPL3P39023 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPL3P39023 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms