Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LTBRP36941 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LTBRP36941 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LTBRP36941 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LTBRP36941 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LTBRP36941 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LTBRP36941 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LTBRP36941 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LTBRP36941 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
LTBRP36941 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LTBRP36941 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LTBRP36941 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LTBRP36941 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LTBRP36941 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LTBRP36941 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LTBRP36941 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LTBRP36941 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LTBRP36941 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LTBRP36941 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LTBRP36941 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
LTBRP36941 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LTBRP36941 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LTBRP36941 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LTBRP36941 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
LTBRP36941 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LTBRP36941 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LTBRP36941 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LTBRP36941 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LTBRP36941 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LTBRP36941 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LTBRP36941 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LTBRP36941 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LTBRP36941 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LTBRP36941 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
LTBRP36941 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LTBRP36941 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LTBRP36941 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LTBRP36941 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LTBRP36941 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
LTBRP36941 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LTBRP36941 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LTBRP36941 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LTBRP36941 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LTBRP36941 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LTBRP36941 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LTBRP36941 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LTBRP36941 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
LTBRP36941 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
LTBRP36941 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LTBRP36941 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LTBRP36941 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LTBRP36941 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
LTBRP36941 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LTBRP36941 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LTBRP36941 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LTBRP36941 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LTBRP36941 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
LTBRP36941 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LTBRP36941 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LTBRP36941 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LTBRP36941 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
LTBRP36941 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
LTBRP36941 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
LTBRP36941 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LTBRP36941 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LTBRP36941 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LTBRP36941 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LTBRP36941 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LTBRP36941 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LTBRP36941 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LTBRP36941 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LTBRP36941 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LTBRP36941 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LTBRP36941 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
LTBRP36941 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LTBRP36941 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LTBRP36941 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
LTBRP36941 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LTBRP36941 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LTBRP36941 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LTBRP36941 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LTBRP36941 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
LTBRP36941 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LTBRP36941 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LTBRP36941 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LTBRP36941 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LTBRP36941 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LTBRP36941 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
LTBRP36941 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LTBRP36941 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LTBRP36941 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LTBRP36941 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LTBRP36941 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LTBRP36941 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LTBRP36941 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LTBRP36941 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
LTBRP36941 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LTBRP36941 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LTBRP36941 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
LTBRP36941 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms